OPN3

edit
Opsin 3 (encefalopsin, panopsin)
Identifikatori
SimboliOPN3; ECPN
Vanjski IDOMIM: 606695 MGI: 1338022 HomoloGene: 40707 IUPHAR: OPN3 GeneCards: OPN3 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija • aktivnost rodopsinu-sličnog receptora
• receptorska aktivnost
• aktivnost G-protein spregnutog fotoreceptora
Celularna komponenta • integralno sa ćelijskom membranom
• membrana
• integralno sa membranom
Biološki proces • prenos signala
• signalni put G-protein spregnutog receptora
• vizuelna percepcija
• fototransdukcija
• protein-hromofor veza
• regulacija cirkadijanskog ritama
• respons na stimulus
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez2359613603
EnsemblENSG00000054277ENSMUSG00000026525
UniProtQ9H1Y3Q3KR48
RefSeq (mRNA)NM_001030011NM_010098
RefSeq (protein)NP_001025182NP_034228
Lokacija (UCSC)Chr 1:
239.82 - 239.87 Mb		Chr 1:
177.5 - 177.53 Mb
PubMed pretraga[1][2]

OPN3, ili Opsin-3, je protein koji je kod čoveka kodiran OPN3 genom.[1][2][3] Alternativno splajsovanje ovog gena proizvodi više transkriptnih varijanti, koje kodiraju različite proteinske izoforme.

Funkcija

Opsini su članovi familije G protein-spregnutih receptora. Osim vizuelnih opsina, sisari poseduje nekoliko fotoreceptivnih ne-vizuelnih opsina koji su izraženi u tkivima izvan oka. Gen opsina-3 je u znatnoj meri izražen u mozgu i testisima, a u maloj meri i u jetri, materici, srcu, plućima, skeletalnim mišima, bubrezima, i pankreasu. Ovaj gene isto tako može da bude izražen u mrežnjači. Ovaj protein poseduje kanoničke osobine fotoreceptivnih opsina.[3]

Literatura

  1. ↑ Blackshaw S, Snyder SH (Jun 1999). „Encephalopsin: a novel mammalian extraretinal opsin discretely localized in the brain”. J Neurosci 19 (10): 3681–90. PMID 10234000. 
  2. ↑ Halford S, Freedman MS, Bellingham J, Inglis SL, Poopalasundaram S, Soni BG, Foster RG, Hunt DM (Jun 2001). „Characterization of a novel human opsin gene with wide tissue expression and identification of embedded and flanking genes on chromosome 1q43”. Genomics 72 (2): 203–8. DOI:10.1006/geno.2001.6469. PMID 11401433. 
  3. ↑ 3,0 3,1 „Entrez Gene: OPN3 opsin 3 (encephalopsin, panopsin)”. 

Dodatna literatura

  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery.”. Genome Res. 6 (9): 791–806. DOI:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548. 
  • Halford S, Bellingham J, Ocaka L i dr.. (2002). „Assignment of panopsin (OPN3) to human chromosome band 1q43 by in situ hybridization and somatic cell hybrids.”. Cytogenet. Cell Genet. 95 (3-4): 234–5. DOI:10.1159/000059351. PMID 12063405. 
  • Kasper G, Taudien S, Staub E i dr.. (2003). „Different structural organization of the encephalopsin gene in man and mouse.”. Gene 295 (1): 27–32. DOI:10.1016/S0378-1119(02)00799-0. PMID 12242008. 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i dr.. (2003). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932. 
  • Alam NA, Gorman P, Jaeger EE i dr.. (2004). „Germline deletions of EXO1 do not cause colorectal tumors and lesions which are null for EXO1 do not have microsatellite instability.”. Cancer Genet. Cytogenet. 147 (2): 121–7. DOI:10.1016/S0165-4608(03)00196-1. PMID 14623461. 
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i dr.. (2004). „The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).”. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334. 
  • Gregory SG, Barlow KF, McLay KE i dr.. (2006). „The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1.”. Nature 441 (7091): 315–21. DOI:10.1038/nature04727. PMID 16710414. 
  • p
  • r
  • u
Klasa A: Rodopsinu slični
α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi
Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)
Metaboliti i
signalni molekuli
CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi
Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat  • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6)  • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat
Peptid
B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)
Drugi
Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)
Razno
GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi
Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)
Klasa B: Sekretinu slični
GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi
Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon
TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi
Klasa F:
Frizzled / Zaglađeni
Uvojiti
Frizzled (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10)
Zaglađeni
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)