CELSR2

edit
Kadherin, EGF LAG sedmoprolazani G-tip receptor 2 (flamingo homolog, Drozofila)
Identifikatori
SimboliCELSR2; CDHF10; EGFL2; Flamingo1; MEGF3
Vanjski IDOMIM: 604265 MGI: 1858235 HomoloGene: 1078 IUPHAR: CELSR2 GeneCards: CELSR2 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija • aktivnost G protein spregnutog receptora
• proteinsko vezivanje
Celularna komponenta • integralno sa ćelijskom membranom
• integralno sa membranom
• membranska frakcija
Biološki proces • signalni put G protein spregnutog receptora
• neuronska migracija
• regulacija transkripcije, DNK-zavisna
• homofilna ćelijska adhezija
• neuropeptidni signalni put
• spermatogeneza
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez195253883
EnsemblENSG00000143126ENSMUSG00000068740
UniProtQ9HCU4A2AEE6
RefSeq (mRNA)NM_001408.2NM_001004177.2
RefSeq (protein)NP_001399.1NP_001004177.2
Lokacija (UCSC)Chr 1:
109.79 - 109.82 Mb		Chr 3:
108.19 - 108.22 Mb
PubMed pretraga[1][2]

Kadherin EGF LAG sedmoprolazni G-tip receptor 2 je protein koji je kod ljudi kodiran CELSR2 genom.[1][2]

Ovaj protein je član flamingo familije, koja pripada kadherinskoj superfamiliji. Flamingo familija se sastoji od neklasičnog tipa kadherina. Ta grupa ne formira interakcije sa kateninima. Flamingo kadherini su locirani u ćelijskoj membrani i imaju devet kadherinskih domena, sedam epidermalnom faktoru rasta sličnih ponavljanja i dva laminin A G-tip ponavljanja u njihovom ektodomenu. Oni takođe imaju sedam transmembranskih domena, koji su karakteristični za ovu potfamiliju. Smatra se da su ovi proteini receptori koji učestvuju u kontaktom posredovanoj komunikaciji. Kadherinski domeni deluju kao homofilni vezujući regioni i EGF-slični domeni koji učestvuju u ćelijskoj adheziji i receptor-ligand interakcijama. CELSR1 ima nepoznatu ulogu.[2]

Reference

  1. ↑ Nakayama M, Nakajima D, Nagase T, Nomura N, Seki N, Ohara O (Sep 1998). „Identification of high-molecular-weight proteins with multiple EGF-like motifs by motif-trap screening”. Genomics 51 (1): 27–34. DOI:10.1006/geno.1998.5341. PMID 9693030. 
  2. ↑ 2,0 2,1 „Entrez Gene: CELSR2 cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (flamingo homolog, Drosophila)”. 

Literatura

  • Nagase T, Seki N, Ishikawa K, et al. (1997). „Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. VI. The coding sequences of 80 new genes (KIAA0201-KIAA0280) deduced by analysis of cDNA clones from cell line KG-1 and brain.”. DNA Res. 3 (5): 321–9, 341–54. DOI:10.1093/dnares/3.5.321. PMID 9039502. 
  • Wu Q, Maniatis T (1999). „A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes.”. Cell 97 (6): 779–90. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8. PMID 10380929. 
  • Wu Q, Maniatis T (2000). „Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (7): 3124–9. DOI:10.1073/pnas.060027397. PMC 16203. PMID 10716726. 
  • Vincent JB, Skaug J, Scherer SW (2001). „The human homologue of flamingo, EGFL2, encodes a brain-expressed large cadherin-like protein with epidermal growth factor-like domains, and maps to chromosome 1p13.3-p21.1”. DNA Res. 7 (3): 233–5. DOI:10.1093/dnares/7.3.233. PMID 10907856. 
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). „Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039. 

Vidi još

  • Flamingo (protein)
  • p
  • r
  • u
Klasa A: Rodopsinu slični
α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi
Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)
Metaboliti i
signalni molekuli
CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi
Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat  • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6)  • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat
Peptid
B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)
Drugi
Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)
Razno
GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi
Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)
Klasa B: Sekretinu slični
GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi
Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon
TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi
Klasa F:
Frizzled / Zaglađeni
Uvojiti
Frizzled (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10)
Zaglađeni
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)