TRPC1

Ідентифікатори

Символи

TRPC1, HTRP-1, TRP1, transient receptor potential cation channel subfamily C member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602343 MGI: 109528 HomoloGene: 2478 GeneCards: TRPC1

Реагує на сполуку

2-aminoethoxydiphenylborate^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• store-operated calcium channel activity • transmembrane transporter binding • calcium channel activity • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cation channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • receptor complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cation channel complex
Біологічний процес	• melanin biosynthetic process • regulation of cardiac conduction • regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • ion transport • response to calcium ion • calcium ion transmembrane transport • manganese ion transport • calcium ion transport • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7220


22063

Ensembl


ENSG00000144935


ENSMUSG00000032839

UniProt


P48995


Q61056

RefSeq (мРНК)


NM_001251845 NM_003304


NM_011643 NM_001311123

RefSeq (білок)


NP_001238774 NP_003295


NP_001298052 NP_035773

Локус (UCSC)

Хр. 3: 142.72 – 142.81 Mb

Хр. 9: 95.59 – 95.63 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPC1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 91 212^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMAALYPSTD	LSGASSSSLP	SSPSSSSPNE	VMALKDVREV	KEENTLNEKL
FLLACDKGDY	YMVKKILEEN	SSGDLNINCV	DVLGRNAVTI	TIENENLDIL
QLLLDYGCQS	ADALLVAIDS	EVVGAVDILL	NHRPKRSSRP	TIVKLMERIQ
NPEYSTTMDV	APVILAAHRN	NYEILTMLLK	QDVSLPKPHA	VGCECTLCSA
KNKKDSLRHS	RFRLDIYRCL	ASPALIMLTE	EDPILRAFEL	SADLKELSLV
EVEFRNDYEE	LARQCKMFAK	DLLAQARNSR	ELEVILNHTS	SDEPLDKRGL
LEERMNLSRL	KLAIKYNQKE	FVSQSNCQQF	LNTVWFGQMS	GYRRKPTCKK
IMTVLTVGIF	WPVLSLCYLI	APKSQFGRII	HTPFMKFIIH	GASYFTFLLL
LNLYSLVYNE	DKKNTMGPAL	ERIDYLLILW	IIGMIWSDIK	RLWYEGLEDF
LEESRNQLSF	VMNSLYLATF	ALKVVAHNKF	HDFADRKDWD	AFHPTLVAEG
LFAFANVLSY	LRLFFMYTTS	SILGPLQISM	GQMLQDFGKF	LGMFLLVLFS
FTIGLTQLYD	KGYTSKEQKD	CVGIFCEQQS	NDTFHSFIGT	CFALFWYIFS
LAHVAIFVTR	FSYGEELQSF	VGAVIVGTYN	VVVVIVLTKL	LVAMLHKSFQ
LIANHEDKEW	KFARAKLWLS	YFDDKCTLPP	PFNIIPSPKT	ICYMISSLSK
WICSHTSKGK	VKRQNSLKEW	RNLKQKRDEN	YQKVMCCLVH	RYLTSMRQKM
QSTDQATVEN	LNELRQDLSK	FRNEIRDLLG	FRTSKYAMFY	PRN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

Zhu X., Chu P.B., Peyton M., Birnbaumer L. (1995). Molecular cloning of a widely expressed human homologue for the Drosophila trp gene. FEBS Lett. 373: 193—198. PMID 7589464 DOI:10.1016/0014-5793(95)01038-G
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Xu S.-Z., Beech D.J. (2001). TrpC1 is a membrane-spanning subunit of store-operated Ca(2+) channels in native vascular smooth muscle cells. Circ. Res. 88: 84—87. PMID 11139478 DOI:10.1161/01.RES.88.1.84
Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12333 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, P48995 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані