CLIC2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2PER, 2R4V, 2R5G

Ідентифікатори

Символи

CLIC2, CLIC2b, MRXS32, XAP121, chloride intracellular channel 2, CLCNL2

Зовнішні ІД

OMIM: 300138 HomoloGene: 48010 GeneCards: CLIC2

Пов'язані генетичні захворювання

X-linked intellectual disability-cardiomegaly-congestive heart failure syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• glutathione transferase activity • voltage-gated ion channel activity • glutathione peroxidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chloride channel activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинний • chloride channel complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity • positive regulation of binding • chloride transport • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular oxidant detoxification • glutathione metabolic process • chloride transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1193


294141

Ensembl


ENSG00000155962


ENSRNOG00000000728

UniProt


O15247


Q5M883

RefSeq (мРНК)


NM_001289


NM_001009651

RefSeq (білок)


NP_001280


NP_001009651

Локус (UCSC)

Хр. X: 155.28 – 155.33 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLIC2 (англ. Chloride intracellular channel 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 амінокислот, а молекулярна маса — 28 356^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGLRPGTQV	DPEIELFVKA	GSDGESIGNC	PFCQRLFMIL	WLKGVKFNVT
TVDMTRKPEE	LKDLAPGTNP	PFLVYNKELK	TDFIKIEEFL	EQTLAPPRYP
HLSPKYKESF	DVGCNLFAKF	SAYIKNTQKE	ANKNFEKSLL	KEFKRLDDYL
NTPLLDEIDP	DSAEEPPVSR	RLFLDGDQLT	LADCSLLPKL	NIIKVAAKKY
RDFDIPAEFS	GVWRYLHNAY	AREEFTHTCP	EDKEIENTYA	NVAKQKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Heiss N.S., Poustka A. (1997). Genomic structure of a novel chloride channel gene, CLIC2, in Xq28. Genomics. 45: 224—228. PMID 9339381 DOI:10.1006/geno.1997.4922
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fan L., Yu W., Zhu X. (2003). Interaction of sedlin with chloride intracellular channel proteins. FEBS Lett. 540: 77—80. PMID 12681486 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00228-X
Board P.G., Coggan M., Watson S., Gage P.W., Dulhunty A.F. (2004). CLIC-2 modulates cardiac ryanodine receptor Ca2+ release channels. Int. J. Biochem. Cell Biol. 36: 1599—1612. PMID 15147738 DOI:10.1016/j.biocel.2004.01.026
Dulhunty A.F., Pouliquin P., Coggan M., Gage P.W., Board P.G. (2005). A recently identified member of the glutathione transferase structural family modifies cardiac RyR2 substate activity, coupled gating and activation by Ca2+ and ATP. Biochem. J. 390: 333—343. PMID 15916532 DOI:10.1042/BJ20042113
Mi W., Liang Y.-H., Li L., Su X.-D. (2008). The crystal structure of human chloride intracellular channel protein 2: a disulfide bond with functional implications. Proteins. 71: 509—513. PMID 18186468 DOI:10.1002/prot.21922

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CLIC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2063 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O15247 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані