CLCA1

Ідентифікатори

Символи

CLCA1, CACC, CACC1, CLCRG1, CaCC-1, GOB5, hhCaCC-1, chloride channel accessory 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603906 MGI: 1346342 HomoloGene: 984 GeneCards: CLCA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • chloride channel activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity
Клітинна компонента	• extracellular region • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • Мікроворсинки • zymogen granule membrane • мембрана • клітинна мембрана • secretory granule • міжклітинний простір
Біологічний процес	• calcium ion transport • протеоліз • chloride transport • ion transport • ion transmembrane transport • cellular response to hypoxia • chloride transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1179


23844

Ensembl


ENSG00000016490


ENSMUSG00000028255

UniProt


A8K7I4


Q9D7Z6

RefSeq (мРНК)


NM_001285


NM_017474

RefSeq (білок)


NP_001276


NP_059502

Локус (UCSC)

Хр. 1: 86.47 – 86.5 Mb

Хр. 3: 144.71 – 144.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLCA1 (англ. Chloride channel accessory 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 914 амінокислот, а молекулярна маса — 100 226^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPFKSSVFI	LILHLLEGAL	SNSLIQLNNN	GYEGIVVAID	PNVPEDETLI
QQIKDMVTQA	SLYLLEATGK	RFYFKNVAIL	IPETWKTKAD	YVRPKLETYK
NADVLVAEST	PPGNDEPYTE	QMGNCGEKGE	RIHLTPDFIA	GKKLAEYGPQ
GRAFVHEWAH	LRWGVFDEYN	NDEKFYLSNG	RIQAVRCSAG	ITGTNVVKKC
QGGSCYTKRC	TFNKVTGLYE	KGCEFVLQSR	QTEKASIMFA	QHVDSIVEFC
TEQNHNKEAP	NKQNQKCNLR	STWEVIRDSE	DFKKTTPMTT	QPPNPTFSLL
QIGQRIVCLV	LDKSGSMATG	NRLNRLNQAG	QLFLLQTVEL	GSWVGMVTFD
SAAHVQNELI	QINSGSDRDT	LAKRLPAAAS	GGTSICSGLR	SAFTVIRKKY
PTDGSEIVLL	TDGEDNTISG	CFNEVKQSGA	IIHTVALGPS	AAQELEELSK
MTGGLQTYAS	DQVQNNGLID	AFGALSSGNG	AVSQRSIQLE	SKGLTLQNSQ
WMNGTVIVDS	TVGKDTLFLI	TWTMQPPQIL	LWDPSGQKQG	GFVVDKNTKM
AYLQIPGIAK	VGTWKYSLQA	SSQTLTLTVT	SRASNATLPP	ITVTSKTNKD
TSKFPSPLVV	YANIRQGASP	ILRASVTALI	ESVNGKTVTL	ELLDNGAGAD
ATKDDGVYSR	YFTTYDTNGR	YSVKVRALGG	VNAARRRVIP	QQSGALYIPG
WIENDEIQWN	PPRPEINKDD	VQHKQVCFSR	TSSGGSFVAS	DVPNAPIPDL
FPPGQITDLK	AEIHGGSLIN	LTWTAPGDDY	DHGTAHKYII	RISTSILDLR
DKFNESLQVN	TTALIPKEAN	SEEVFLFKPE	NITFENGTDL	FIAIQAVDKV
DLKSEISNIA	RVSLFIPPQT	PPETPSPDET	SAPCPNIHIN	STIPGIHILK
IMWKWIGELQ	LSIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
Bustin S.A., Li S.-R., Dorudi S. (2001). Expression of the Ca2+-activated chloride channel genes CLCA1 and CLCA2 is downregulated in human colorectal cancer. DNA Cell Biol. 20: 331—338. PMID 11445004 DOI:10.1089/10445490152122442
Toda M., Tulic M.K., Levitt R.C., Hamid Q. (2002). A calcium-activated chloride channel (HCLCA1) is strongly related to IL-9 expression and mucus production in bronchial epithelium of patients with asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 109: 246—250. PMID 11842292 DOI:10.1067/mai.2002.121555
Thai P., Chen Y., Dolganov G., Wu R. (2005). Differential regulation of MUC5AC/Muc5ac and hCLCA-1/mGob-5 expression in airway epithelium. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 33: 523—530. PMID 16151054 DOI:10.1165/rcmb.2004-0220RC

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2015 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, A8K7I4 (англ.) . Архів оригіналу за 14 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані