KCNIP4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3DD4

Ідентифікатори

Символи

KCNIP4, CALP, KCHIP4, potassium voltage-gated channel interacting protein 4

Зовнішні ІД

OMIM: 608182 MGI: 1933131 HomoloGene: 23528 GeneCards: KCNIP4

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • potassium channel regulator activity • potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мембрана
Біологічний процес	• potassium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • protein localization to plasma membrane • ion transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • cardiac conduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80333


80334

Ensembl


ENSG00000185774 ENSG00000281758


ENSMUSG00000029088

UniProt


Q6PIL6


Q6PHZ8

RefSeq (мРНК)

NM_001035003 NM_001035004 NM_025221 NM_147181 NM_147182
NM_147183 NM_001363504


NM_001199242 NM_001199243 NM_001199244 NM_001199245 NM_030265

RefSeq (білок)

NP_001030175 NP_001030176 NP_079497 NP_671710 NP_671711
NP_671712 NP_001350433


NP_001186171 NP_001186172 NP_001186173 NP_001186174 NP_084541

Локус (UCSC)

Хр. 4: 20.73 – 21.95 Mb

Хр. 5: 48.39 – 49.52 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNIP4 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот, а молекулярна маса — 28 729^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNVRRVESIS	AQLEEASSTG	GFLYAQNSTK	RSIKERLMKL	LPCSAAKTSS
PAIQNSVEDE	LEMATVRHRP	EALELLEAQS	KFTKKELQIL	YRGFKNECPS
GVVNEETFKE	IYSQFFPQGD	STTYAHFLFN	AFDTDHNGAV	SFEDFIKGLS
ILLRGTVQEK	LNWAFNLYDI	NKDGYITKEE	MLDIMKAIYD	MMGKCTYPVL
KEDAPRQHVE	TFFQKMDKNK	DGVVTIDEFI	ESCQKDENIM	RSMQLFENVI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jerng H.H., Pfaffinger P.J. (2008). Multiple Kv channel-interacting proteins contain an N-terminal transmembrane domain that regulates Kv4 channel trafficking and gating. J. Biol. Chem. 283: 36046—36059. PMID 18957440 DOI:10.1074/jbc.M806852200
Kitazawa M., Kubo Y., Nakajo K. (2014). The stoichiometry and biophysical properties of the Kv4 potassium channel complex with K+ channel-interacting protein (KChIP) subunits are variable, depending on the relative expression level. J. Biol. Chem. 289: 17597—17609. PMID 24811166 DOI:10.1074/jbc.M114.563452

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNIP4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30083 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q6PIL6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 травня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані