SUMO protein

Struktura ljudskog SUMO1 proteina bazirana na 1A5R NMR strukturi; osnova proteina je prikazana kao traka; N-terminus je obojen plavo, a C-terminus crveno
Ista struktura sa atomima prikazanim kao sfere prikazuje oblik proteina; ljudski SUMO1, 1A5R

SUMO proteini (engl. Small Ubiquitin-like Modifier) su familija malih proteina koji su kovalentno vezani za pojedine proteine u ćelijama čime modifikuju njihovu funkciju. Sumoilacija je posttranslaciona modifikacija koja učestvuje u raznim ćelijskim procesima, kao što je jedreno-citosolni transport, transkripciona regulacija, apoptoza, proteinska stabilnost, respons na stres, i progresija kroz ćelijski ciklus.[1]

SUMO proteini su slični sa ubikvitinom, i sumoilacijom rukovodi enzimska kaskada koja je analogna sa ubikvitinacijom. Za razliku od ubikvitinacije, SUMO se ne koristi za obeležavanje proteina za degradaciju. Krajnji oblik SUMO proteina se formira kad se zadnje četiri aminokiseline sa C-terminusa odvoje, čime se omogučava formiranje izopeptidne veze između C-terminalnog glicinskog ostatka SUMO proteina i akceptorskog lizina na ciljnom proteinu.

Reference

  1. Hay RT (Apr 2005). „SUMO: a history of modification”. Mol. Cell 18 (1): 1–12. DOI:10.1016/j.molcel.2005.03.012. PMID 15808504. [mrtav link]

Literatura

  • Ulrich HD (Oct 2005). „Mutual interactions between the SUMO and ubiquitin systems: a plea of no contest”. Trends Cell Biol. 15 (10): 525–532. DOI:10.1016/j.tcb.2005.08.002. PMID 16125934. 
  • Gill G (Oct 2005). „Something about SUMO inhibits transcription”. Curr Opin Genet. Dev. 15 (5): 536–541. DOI:10.1016/j.gde.2005.07.004. PMID 16095902. 
  • Li M, Guo D, Isales CM, et al. (Jul 2005). „SUMO wrestling with type 1 diabetes”. J. Mol. Med. 83 (7): 504–513. DOI:10.1007/s00109-005-0645-5. PMID 15806321. 
  • Verger A, Perdomo J, Crossley M (Feb 2003). „Modification with SUMO: A role in transcriptional regulation”. EMBO Rep. 4 (2): 137–142. DOI:10.1038/sj.embor.embor738. PMC 1315836. PMID 12612601. 
  • Peroutka III RJ, Orcutt SJ, Strickler JE, Butt TR (2011). „SUMO fusion technology for enhanced protein expression and purification in prokaryotes and eukaryotes”. Methods Mol. Biol: Heterologous gene expression in E. Coli 705: 15–30. DOI:10.1007/978-1-61737-967-3_2. PMID 21125378.  Download PDF Arhivirano 2013-10-29 na Wayback Machine-u

Vidi još

Spoljašnje veze

  • LifeSensors' SUMO-based Protein and Peptide Expression Systems Arhivirano 2011-03-19 na Wayback Machine-u
  • Proteins Expressed With SUMO[mrtav link]
  • Boston Biochem overview of SUMO reagents and the SUMOylation Cycle
  • p
  • r
  • u
Opšte
Peptidna veza  Biosinteza proteina  Proteoliza  Racemizacija  N-O acilno pomeranje
N-terminusC-terminusSpecifične
aminokiseline
Fosforilacija  Sulfacija  Vezivanje za porfirinski prsten  vezivanje flavina  formiranje p-hidroksibenziliden-imidazolona  formiranje Lizin tirozil kinona (LTQ)  formiranje topakinona (TPQ)
Formiranje sukcinimida
Formiranje diftamida

B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)
  • p
  • r
  • u
Šaperoni/
proteinsko uvijanje
Hsp10/GroES (Faktor rane trudnoće)  Hsp27  Hsp47  HSP60/GroEL

Hsp40/DnaJ (A1, A2, A3, B1, B2, B11, B4, B6, B9, C1, C3, C5, C6, C7, C10, C11, C13, C14, C19)

Hsp70 (1A, 1B, 1L, 2, 4, 4L, 5, 6, 7, 8, 9, 12A, 14)

Hsp90 (α1, α2, β, ER, TRAP1)
Drugi
Alfa kristalin  Klusterin  Opstanak motornog neurona (SMN1, SMN2)
Sortiranje proteina
Ubikvitin
E1 Enzim ubikvitinske aktivacije (UBA1, UBA2, UBA3, UBA5, UBA6, UBA7, ATG7, NAE1, SAE1)

E2 Ubikvitin-konjugujući enzim (A • B • C • D1, D2, D3 • E1, E2, E3 • G1, G2 • H • I • J1, J2 • K • L1, L2, L3, L4, L6 • M • N • O • Q1, Q2 • R1 (CDC34), R2 • S • V1, V2 • Z)

E3 Ubikvitin ligaza (VHL, Kalin, CBL, MDM2, FANCL, UBR1)

Deubikvitinirajući enzim: Ataksin 3 • USP6 • CYLD

ATG3 • BIRC6 • UFC1
Drugi
SUMO protein
vidi još Poremećaji posttranslacionih modifikacija
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)