Prenilacija

Prenilna funkcionalna grupa

Prenilacija (izoprenilacija, lipidacija) je adicija hidrofobnih molekula na protein. Normalno se podrazumeva da prenilne grupe (3-metil-but-2-en-1-il) omogućavaju vezivanje za ćelijske membrane, slično lipidnim ankerima, mada za to nema direktne evidencije. Prenil grupe su važne za protein-protein vezivanje putem specijalizovanih domena za vezivanje prenila.

Proteinska prenilacija

Proteinska prenilacija poboljšava transfer bilo farnezil ili geranil-geranil grupa do C-terminalnih cistein(a) ciljnog proteina. Postoje tri enzima za izvođenje prenilacije u ćeliji, farnezil transferaza, Caax proteaza i geranilgeranil transferaza I.[1]

Farnezilacija je tip prenilacije, posttranslacione modifikacije proteina, putem koje se izoprenilna grupa dodaje na cisteinski ostatak.[2] Farnezilacija je oblik posredovanja protein-protein i protein-membranskih interakcija.[3]

Reference

  1. P. J. Casey and M. C. Seabra (1996). „Protein Prenyltransferases”. Journal of Biological Chemistry 271 (10): 5289–5292. DOI:10.1074/jbc.271.10.5289.  PDF
  2. Maltese WA. Posttranslational modification of proteins by isoprenoids in mammalian cells. FASEB J. 1990 Dec;4(15):3319-28.
  3. G. Novelli and M. R. D'Apice (2012). „Protein farnesylation and disease”. Journal of Inherited Metabolic Disease 35 (5): 917-926. DOI:10.1007/s10545-011-9445-y. 

Literatura

  • Sebastian Maurer-Stroh and Frank Eisenhaber (2005). "Refinement and prediction of protein prenylation motifs" Arhivirano 2014-04-26 na Wayback Machine-u. Genome Biology. 6:R55.
  • Magee A, Seabra M (2003). „Are prenyl groups on proteins sticky fingers or greasy handles?”. Biochem J 376 (Pt 2): e3–4. DOI:10.1042/BJ20031531. PMC 1223795. PMID 14627432. 
  • Taylor J, Reid T, Terry K, Casey P, Beese L (2003). „Structure of mammalian protein geranylgeranyltransferase type-I”. EMBO J 22 (22): 5963–74. DOI:10.1093/emboj/cdg571. PMC 275430. PMID 14609943. 

Vidi još

  • Miristilacija
  • Palmitoilacija

Spoljašnje veze

  • MeSH Prenylation
  • p
  • r
  • u
Primarna struktura proteina i posttranslacione modifikacije
Opšte
Peptidna veza  Biosinteza proteina  Proteoliza  Racemizacija  N-O acilno pomeranje
N-terminusC-terminusSpecifične
aminokiseline
Fosforilacija  Sulfacija  Vezivanje za porfirinski prsten  vezivanje flavina  formiranje p-hidroksibenziliden-imidazolona  formiranje Lizin tirozil kinona (LTQ)  formiranje topakinona (TPQ)
Disulfidna veza  Palmitoilacija  Prenilacija
Formiranje sukcinimida
Formiranje diftamida

B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)