ESRRG

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1KV6, 1TFC, 1VJB, 2E2R, 2EWP, 2GP7, 2GPO, 2GPP, 2GPU, 2GPV, 2P7A, 2P7G, 2P7Z, 2ZAS, 2ZBS, 2ZKC

Ідентифікатори

Символи

ESRRG, ERR3, ERRgamma, NR3B3, estrogen related receptor gamma, ERRg, ERR-gamma

Зовнішні ІД

OMIM: 602969 MGI: 1347056 HomoloGene: 55581 GeneCards: ESRRG

Пов'язані генетичні захворювання

alcohol abuse, великий депресивний розлад, гіпертрофічна кардіоміопатія, unipolar depression^[1]

Реагує на сполуку

biochanin A, Дайджеїн, Геністейн, діетилстільбестрол^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • zinc ion binding • AF-2 domain binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • steroid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • retinoic acid receptor signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2104


26381

Ensembl


ENSG00000196482


ENSMUSG00000026610

UniProt


P62508


P62509

RefSeq (мРНК)

NM_001134285 NM_001243505 NM_001243506 NM_001243507 NM_001243509
NM_001243510 NM_001243511 NM_001243512 NM_001243513 NM_001243514 NM_001243515 NM_001243518 NM_001243519 NM_001438 NM_206594 NM_206595 NM_001350122 NM_001350123 NM_001350124 NM_001350125


NM_001243792 NM_011935 NM_001357534 NM_001357535 NM_001357536

RefSeq (білок)

NP_001127757 NP_001230434 NP_001230435 NP_001230436 NP_001230438
NP_001230439 NP_001230440 NP_001230441 NP_001230442 NP_001230443 NP_001230444 NP_001230447 NP_001230448 NP_001429 NP_996317 NP_996318 NP_001337051 NP_001337052 NP_001337053 NP_001337054


NP_001230721 NP_036065 NP_001344463 NP_001344464 NP_001344465

Локус (UCSC)

Хр. 1: 216.5 – 217.14 Mb

Хр. 1: 187.34 – 187.95 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ESRRG (англ. Estrogen related receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 51 306^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSVELCLPE	SFSLHYEEEL	LCRMSNKDRH	IDSSCSSFIK	TEPSSPASLT
DSVNHHSPGG	SSDASGSYSS	TMNGHQNGLD	SPPLYPSAPI	LGGSGPVRKL
YDDCSSTIVE	DPQTKCEYML	NSMPKRLCLV	CGDIASGYHY	GVASCEACKA
FFKRTIQGNI	EYSCPATNEC	EITKRRRKSC	QACRFMKCLK	VGMLKEGVRL
DRVRGGRQKY	KRRIDAENSP	YLNPQLVQPA	KKPYNKIVSH	LLVAEPEKIY
AMPDPTVPDS	DIKALTTLCD	LADRELVVII	GWAKHIPGFS	TLSLADQMSL
LQSAWMEILI	LGVVYRSLSF	EDELVYADDY	IMDEDQSKLA	GLLDLNNAIL
QLVKKYKSMK	LEKEEFVTLK	AIALANSDSM	HIEDVEAVQK	LQDVLHEALQ
DYEAGQHMED	PRRAGKMLMT	LPLLRQTSTK	AVQHFYNIKL	EGKVPMHKLF
LEMLEAKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Heard D.J., Norby P.L., Holloway J., Vissing H. (2000). Human ERRgamma, a third member of the estrogen receptor-related receptor (ERR) subfamily of orphan nuclear receptors: tissue-specific isoforms are expressed during development and in the adult. Mol. Endocrinol. 14: 382—392. PMID 10707956 DOI:10.1210/mend.14.3.0431
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hong H., Yang L., Stallcup M.R. (1999). Hormone-independent transcriptional activation and coactivator binding by novel orphan nuclear receptor ERR3. J. Biol. Chem. 274: 22618—22626. PMID 10428842 DOI:10.1074/jbc.274.32.22618
Hentschke M., Borgmeyer U. (2003). Identification of PNRC2 and TLE1 as activation function-1 cofactors of the orphan nuclear receptor ERRgamma. Biochem. Biophys. Res. Commun. 312: 975—982. PMID 14651967 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.025
Hentschke M., Suesens U., Borgmeyer U. (2009). Transcriptional ERRgamma2-mediated activation is regulated by sentrin-specific proteases. Biochem. J. 419: 167—176. PMID 19067653 DOI:10.1042/BJ20081556
Tremblay A.M., Wilson B.J., Yang X.-J., Giguere V. (2008). Phosphorylation-dependent sumoylation regulates estrogen-related receptor-alpha and -gamma transcriptional activity through a synergy control motif. Mol. Endocrinol. 22: 570—584. PMID 18063693 DOI:10.1210/me.2007-0357

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ESRRG переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Estrogen related receptor gamma переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3474 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P62508 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма