Proteinsko sortiranje

Proteinsko sortiranje je mehanizam kojim ćelija transportuje proteine do odgovarajućih pozicija u ćeliji ili van ćelije. Sortiranje ciljeva se može odvijati u unutrašnjosti organela, na nekoj od unutrašnjih membrana, ćelijskoj spoljašnjoj membrani, ili u spoljašnjem prostoru putem sekrecije. Ovaj proces isporuke se izvodi na bazi informacija sadržanih u proteinu. Korektno sortiranje je presudno za ćeliju. Greške u sortiranju dovode do bolesti.[1][2]

Signali sortiranja

Signali sortiranja su informacije koje omogućavaju mašineriji ćelijskog transporta da korektno postavi protein unutar ili izvan ćelije. Te informacije su sadržane u polipeptidnom lancu ili savijenom proteinu. Neprekidni segmenti aminokiselinskih ostataka koji omogućavaju sortiranje se naziva signalni peptidi ili sortirajući peptidi. Postoje dva tipa sortirajućih peptida, presekvence i unutrašnji sortirajući peptidi. Presekvence sortirajućih peptida se često nalaze na N-terminalnom kraju, i sastoje se od 6-136 baznih i hidrofobnih aminokiselina. U slučaju peroksizoma, sortirajuće sekvence su uglavnom na C-terminusu. Drugi signali se sastoje od delova koji su razdvojeni u primarnoj sekvenci. Da bi funkcionisale, te komponente moraju da zajedno izađu na površinu proteina prilikom savijanja. One se nazivaju signalnim oblastima. Osim toga, proteinske modifikacije, poput glikozilacije, mogu da indukuju sortiranje.

Vidi još

  • COPI
  • COPII
  • Klatrin
  • LocDB

Reference

  1. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter (2002). Molecular Biology of the Cell. New York: Garlard Science. ISBN 0-8153-3218-1. 
  2. Donald Voet, Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 izd.). Wiley. ISBN 978-0-471-19350-0. 

Spoljašnje veze

  • MeSH Protein+Transport
  • p
  • r
  • u
Proteini
Procesi
Proteinska biosinteza  Posttranslaciona modifikacija  Proteinsko sklapanje  Proteinsko sortiranje  Proteom  Proteinske metode
StruktureTipovi
Biohemijske familije: Ugljeni hidrati (Glikozidi,Alkoholi) • Lipidi (Steroidi,Fosfolipidi,Glikolipidi,Masne kiseline,Tetrapiroli) • Proteini (Aminokiseline,Peptidi,Glikoproteini) • Nukleobaze/Nukleinske kiseline
  • p
  • r
  • u
Šaperoni/
proteinsko uvijanje
Hsp10/GroES (Faktor rane trudnoće)  Hsp27  Hsp47  HSP60/GroEL

Hsp40/DnaJ (A1, A2, A3, B1, B2, B11, B4, B6, B9, C1, C3, C5, C6, C7, C10, C11, C13, C14, C19)

Hsp70 (1A, 1B, 1L, 2, 4, 4L, 5, 6, 7, 8, 9, 12A, 14)

Hsp90 (α1, α2, β, ER, TRAP1)
Drugi
Alfa kristalin  Klusterin  Opstanak motornog neurona (SMN1, SMN2)
Sortiranje proteina
Ubikvitin
E1 Enzim ubikvitinske aktivacije (UBA1, UBA2, UBA3, UBA5, UBA6, UBA7, ATG7, NAE1, SAE1)

E2 Ubikvitin-konjugujući enzim (A • B • C • D1, D2, D3 • E1, E2, E3 • G1, G2 • H • I • J1, J2 • K • L1, L2, L3, L4, L6 • M • N • O • Q1, Q2 • R1 (CDC34), R2 • S • V1, V2 • Z)

E3 Ubikvitin ligaza (VHL, Kalin, CBL, MDM2, FANCL, UBR1)

Deubikvitinirajući enzim: Ataksin 3 • USP6 • CYLD

ATG3 • BIRC6 • UFC1
Drugi
vidi još Poremećaji posttranslacionih modifikacija
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)