PTAFR

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2B0X

Ідентифікатори

Символи

PTAFR, PAFR, platelet activating factor receptor

Зовнішні ІД

OMIM: 173393 MGI: 106066 HomoloGene: 20260 GeneCards: PTAFR

Реагує на сполуку

PAF^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity • G protein-coupled purinergic nucleotide receptor activity • lipopolysaccharide binding • signal transducer activity • mitogen-activated protein kinase binding • platelet activating factor receptor activity • phospholipid binding • lipopolysaccharide immune receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane • tertiary granule membrane
Біологічний процес	• G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of leukocyte tethering or rolling • inositol trisphosphate biosynthetic process • positive regulation of voltage-gated chloride channel activity • positive regulation of phospholipase C activity • negative regulation of blood pressure • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of inositol phosphate biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcytosis • GO:0032617 cytokine production • response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine • response to symbiotic bacterium • Цитопемпсис • positive regulation of translation • cellular response to gravity • response to dexamethasone • positive regulation of cellular extravasation • positive regulation of maternal process involved in parturition • хемотаксис • cellular response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine • positive regulation of sensory perception of pain • response to lipopolysaccharide • cellular response to fatty acid • response to organophosphorus • народження • positive regulation of vasoconstriction • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of gastro-intestinal system smooth muscle contraction • positive regulation of tumor necrosis factor production • inflammatory response • positive regulation of smooth muscle contraction • positive regulation of neutrophil degranulation • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion • phosphatidylinositol-mediated signaling • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • cellular response to cAMP • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • G protein-coupled purinergic nucleotide receptor signaling pathway • neutrophil degranulation • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5724


19204

Ensembl


ENSG00000169403


ENSMUSG00000056529

UniProt


P25105


Q62035

RefSeq (мРНК)


NM_001164723 NM_000952 NM_001164721 NM_001164722


NM_001081211

RefSeq (білок)


NP_000943 NP_001158193 NP_001158194 NP_001158195


NP_001074680

Локус (UCSC)

Хр. 1: 28.15 – 28.19 Mb

Хр. 4: 132.29 – 132.31 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTAFR (англ. Platelet activating factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 39 203^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPHDSSHMD	SEFRYTLFPI	VYSIIFVLGV	IANGYVLWVF	ARLYPCKKFN
EIKIFMVNLT	MADMLFLITL	PLWIVYYQNQ	GNWILPKFLC	NVAGCLFFIN
TYCSVAFLGV	ITYNRFQAVT	RPIKTAQANT	RKRGISLSLV	IWVAIVGAAS
YFLILDSTNT	VPDSAGSGNV	TRCFEHYEKG	SVPVLIIHIF	IVFSFFLVFL
IILFCNLVII	RTLLMQPVQQ	QRNAEVKRRA	LWMVCTVLAV	FIICFVPHHV
VQLPWTLAEL	GFQDSKFHQA	INDAHQVTLC	LLSTNCVLDP	VIYCFLTKKF
RKHLTEKFYS	MRSSRKCSRA	TTDTVTEVVV	PFNQIPGNSL	KN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Ye R.D., Prossnitz E.R., Zou A., Cochrane C.G. (1991). Characterization of a human cDNA that encodes a functional receptor for platelet activating factor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 180: 105—111. PMID 1656963 DOI:10.1016/S0006-291X(05)81261-6
Seyfried C.E., Schweickart V.L., Godiska R., Gray P.W. (1992). The human platelet-activating factor receptor gene (PTAFR) contains no introns and maps to chromosome 1. Genomics. 13: 832—834. PMID 1322356 DOI:10.1016/0888-7543(92)90162-L
Chase P.B., Halonen M., Regan J.W. (1993). Cloning of a human platelet-activating factor receptor gene: evidence for an intron in the 5'-untranslated region. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 8: 240—244. PMID 8383507 DOI:10.1165/ajrcmb/8.3.240
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kunz D., Gerard N.P., Gerard C. (1992). The human leukocyte platelet-activating factor receptor. cDNA cloning, cell surface expression, and construction of a novel epitope-bearing analog. J. Biol. Chem. 267: 9101—9106. PMID 1374385

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet activating factor receptor переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9582 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P25105 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Трансмембранні рецептори: G-білокспряжені рецептори

Клас A: Родопсин-подібні

Рецептори нейромедіаторів

Адренорецептори	α1 A B D α2 A B C β1 β2 β3

Пуринові рецептори	Аденозинові рецептори A1 A2A A2B A3 P2Y 1 2 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14

Серотонінові рецептори	(крім 5-HT3) 5-HT1 A B D E F) 5-HT2 A B C 5-HT 4 5A 6 7)

Інші	Мускариновий ацетилхоліновий рецептор M1 M2 M3 M4 M5 Дофамінові рецептори D1 D2 D3 D4 D5 GHB-рецептор Гістамінові рецептори H1 H2 H3 H4 Мелатонінові рецептори 1A 1B 1C TAAR 1 2 5 6 8 9

Метаболіти та
сигнальні молекули

Ейкозаноїдні рецептори	CysLT 1 2 LTB4 1 2 FPR2 OXER1 Простагландинові рецептори DP 1 2 EP 1 2 3 4) FP PTGIR TBXA2R

Інші	Жовчні кислоти Канабіноїдні рецептори CB1 CB2 GPR 18 55 119 EBI2 Естроген Рецептори вільних жирних кислот 1 2 3 4 HCAR 1 2 3 LPAR 1 2 3 4 5 6 S1PR 1 2 3 4 5 OXGR1 PTAFR SUCNR1

Пептиди

Рецептори нейропептидів	B/W 1 2 FF 1 2 S Y 1 2 4 5 Нейромедин B U 1 2 Нейротенсин 1 2

Інші	Анафілатоксин C3a C5a 1 2 Ангіатонзин 1 2 Апелін Бомбезин BRS3 GRPR NMBR Брадикинін B1 B2 Хемокиновий рецептор Холецистокинін A B Ендотилін A B FPR 1 2 3 FSHR Галанін 1 2 3 GNRHR 1 2 GHSR KISS1R LHCGR MAS 1 1L D E F G X1 X2 X3 X4 Меланокортин 1 2 3 4 5 MCHR 1 2 MLNR Опіати Δ Κ Μ OPRL1 OGFR Орексин 1 2 Окситоцин Прокінетецин 1 2 PRLHR Релаксин 1 2 3 4 Рецептори соматостатинів 1 2 3 4 5 Тахінін 1 2 3 Рецептор тиреотропного гормону TRHR UTS2R Рецептори вазопресину 1A 1B 2

Різні

Смак, гірке	TAS2R 1 3 4 5 7 8 9 10 13 14 16 19 20 30 31 38 39 40 41 42 43 45 46 50 60 VN1R 1 2 3 4 5

Орфанні	GPR (1 3 4 6 12 15 17 18 19 20 21 22 23 25 26 27 31 32 33 34 35 37 39 42 44 45 50 52 55 61 62 63 65 68 75 77 78 81 82 83 84 85 87 88 92 101 103 109A 109B 119 120 132 135 137B 139 141 142 146 148 149 150 151 152 153 160 161 162 171 173 174 176 177 182 183)

Інші	GPR182 Запах Опсин 3 4 5 1LW 1MW 1SW RGR RRH F2R 1 2 3 4 SREB 1 2 3

Клас B: Секретин-подібні

Адгезивні	ADGRG 1 2 3 4 5 6 7

Орфанні	GPR (56 64 97 98 110 111 112 113 114 115 116 123 124 125 126 128 133 143 144 155 157)

Інші	ADGRB 1 2 3 CELSR 1 2 3 Кальцитонін CALCRL ADGRE5 CRHR 1 2 EMR 1 2 3 Глюкагон GR GIPR GLP1R GLP2R GHRHR PACAPR1 Латрофілін 1 2 3 4 PTH 1 2 SCTR VIPR 1 2

Клас C: Метаботропні глутаматні рецептори / феромони

Смак, солодке	TAS1R 1 2 3 VN2R

Other	CASR ГАМК-рецептори 1 2 Глутаматні рецептори Метаботропні глутаматні 1 2 3 4 5 6 7 8 GPRC6A GPR 156 158 179 RAIG 1 2 3 4