Reverzna transkriptaza

Reverzna transkriptaza
(RNA zavisna DNK polimeraza)
Kristalografska struktura HIV reverzne transkriptaze. [1]
Identifikatori
Simbol RVT_1
Pfam PF00078
Pfam klan CL0027
InterPro IPR000477
PROSITE PS50878
SCOP 1hmv
Superfamilija 1hmv
CDD cd00304
Dostupne PDB strukture:
Pfam structures
PDB RCSB PDB; PDBe
PDBsum strukturni pregled
RNK usmerena DNK polimeraza
Identifikatori
EC broj 2.7.7.49
CAS broj 9068-38-6
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
KEGG KEGG entry
MetaCyc metabolic pathway
PRIAM profile
PDB RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Ontologija gena AmiGO / EGO
Pretraga
PMC articles
PubMed articles
NCBI Protein search

U molekularnoj biologiji i biohemiji, reverzna transkriptaza (RNK zavisna DNK polimeraza) je DNK polimerazni enzim koji transkribuje jednolančanu RNK u jednolančanu DNK. Ona je isto tako DNK zavisna DNK polimeraza koja sintetiše drugi lanac DNK komplementaran sa reverzno transkribovanom jednolačanom cDNK nakon degradacije originalne iRNK. Ovaj enzim se naziva reverznim zato što normalna transkripcija obuhvata sintezu RNK iz DNK.

Dobro izučene reverzne transkriptaze su:

  • HIV-1 reverzna transkriptaza iz HIV tipa 1 (PDB 1HMV)
  • M-MLV reverzna transkriptaza iz virusa leukemije glodara
  • AMV reverzna transkriptaza iz alfaretrovirusa
  • Telomerazna reverzna transkriptaza koja održava telomere eukariotskih hromozoma.

Reference

  1. ↑ PDB 3KLF; Tu X, Das K, Han Q, Bauman JD, Clark AD Jr, Hou X, Frenkel YV, Gaffney BL, Jones RA, Boyer PL, Hughes SH, Sarafianos SG, Arnold E (September 2010). „Structural basis of HIV-1 resistance to AZT by excision.”. Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (10): 1202–9. DOI:10.1038/nsmb.1908. PMC 2987654. PMID 20852643. 

Literatura

  • Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X. 
  • Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842. 

Vidi još

Spoljašnje veze

  • MeSH RNA+Transcriptase
  • Animacija dejstva reverzne transkriptaze Arhivirano 2006-05-17 na Wayback Machine-u
  • p
  • r
  • u
Transferaze: fosfor-sadržavajuće grupe (EC 2.7)
2.7.1-2.7.4:
fosfotransferaze/kinaze
(PO4)
2.7.1: OH- akceptor
2.7.2: COOH akceptor
2.7.3: N akceptor
2.7.4: PO4 akceptor
2.7.6: difosfotransferaze
(P2O7)2.7.7: nukleotidiltransferaza
(PO4-nukleozid)
DNK-usmerena DNK polimeraza: DNK polimeraza I • DNA polimeraza II • DNA polimeraza III holoenzim

RNK-usmerena DNA polimeraza: Reverzna transkriptaza (Telomeraza)

DNK nukleotidileksotransferaza/Terminalna deoksinukleotidil transferaza
RNK nukleotidiltransferaza
Druge
2.7.8: razno
Fosfatidiltransferaze
Glikozil-1-fosfotransferaza
2.7.10-2.7.13: proteinske kinaze
(PO4; proteinski akceptor)
vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.12: dualna specifičnost
vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.13: protein-histidinske
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6