Jonski kanal

Jonski kanali su proteini koji formiraju pore koje pomažu u uspostavljanju i kontroli naponskog gradijenta preko ćelijske membrane (vidi ćelijski potencijal) putem omogućavanja protoka jona niz njihov elektrohemijski gradijent.^[1]^[2] Oni su prisutni u membranama koje okružuju sve biološke ćelije. Studiranje jonskih kanala obuhvata mnoge naučne tehnike kao što su elektrofiziologija naponske spone (posebno slojna spona), imunohistohemija, i RT-PCR.

Reference

↑ Hille, Bertil (2001). Ion Channels of Excitable Membranes (3rd izd.). Sunderland, Mass: Sinauer Associates. ISBN 0-87893-321-2.
↑ Donald Voet, Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 izd.). Wiley. ISBN 978-0-471-19350-0.

Literatura

An Interview with Roderick MacKinnon Freeview video by the Vega Science Trust.
Doyle DA, Morais Cabral J, Pfuetzner RA, Kuo A, Gulbis JM, Cohen SL, Chait BT, MacKinnon R (April 1998). „The structure of the potassium channel: molecular basis of K+ conduction and selectivity”. Science 280 (5360): 69–77. Bibcode 1998Sci...280...69D. DOI:10.1126/science.280.5360.69. PMID 9525859. Arhivirano iz originala na datum 2009-09-26. Pristupljeno 2014-03-17.
Bezanilla F (April 2000). „The voltage sensor in voltage-dependent ion channels”. Physiol. Rev. 80 (2): 555–92. PMID 10747201.
Singh H (2010). „Two decades with dimorphic Chloride Intracellular Channels (CLICs)”. Febs letters. 584 (10): 2112–21. DOI:10.1016/j.febslet.2010.03.013. PMID 20226783.
Catterall WA (2010). „Ion Channel Voltage Sensors: Structure, Function, and Pathophysiology”. Neuron 67 (6): 915–928. DOI:10.1016/j.neuron.2010.08.021. PMC 2950829. PMID 20869590.
Kathy Liszewski (15. 6. 2007.). „Opening the Gates on Ion Channel Drugs”. Genetic Engineering & Biotechnology News (Mary Ann Liebert, Inc.): str. 18, 20. Arhivirano iz originala na datum 2009-01-13. Pristupljeno 6. 7. 2008. »Conditions targeted include diabetes, cystic fibrosis, hypertension, pain and cancer«
Shahidul, Islam (January 2011). Transient Receptor Potential Channels. Advances in Experimental Medicine and Biology. 704. Berlin: Springer. str. 700. ISBN 978-94-007-0264-6.
Hille, Bertil (2001). Ion Channels of Excitable Membranes (3rd izd.). Sunderland, Mass: Sinauer Associates.

Vidi još

Spoljašnje veze

„Voltage-Gated Ion Channels”. IUPHAR Database of Receptors and Ion Channels. International Union of Basic and Clinical Pharmacology. Arhivirano iz originala na datum 2016-06-25.
„TRIP Database”. a manually curated database of protein-protein interactions for mammalian TRP channels. Arhivirano iz originala na datum 2016-08-10.
AurSCOPE Ion Channels Database Arhivirano 2011-05-06 na Wayback Machine-u

Membranski transportni proteini: Jonski kanali (TC 1A)

Ca²⁺: Kalcijumski kanal

Naponom-kontrolisani	L-tip/Ca_vα (1.1, 1.2, 1.3, 1.4) • N-tip/Ca_vα2.2 • P-tip/Ca_vα(2.1) • Q-tip/Ca_vα2.1 • R-tip/Ca_vα2.3 • T-tip/Ca_vα(3.1, 3.2, 3.3) α₂δ-podjedinice (1, 2) • β-podjedinice (β1, β2, β3, β4) • γ-podjedinice (γ1, γ2, γ3, γ4) [Katjonski kanali sperme]] (1, 2, 3, 4) •Dvoporni kanal (1, 2)
Ligand-kontrolisani	Inozitol trisfosfatni receptor (1, 2, 3) • Rianodinski receptor (1, 2, 3)

Na⁺: Natrijumski kanal

Naponom-kontrolisani	Na_vα (1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 7A) • Na_vβ (1, 2, 3, 4)
Konstitutivno aktivni	Epitelni Natrijumski kanal (α, β, γ, δ)

K⁺: Kalijumski kanal

Naponom-kontrolisani	K_vα1-6 (1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 1.8) • (2.1, 2.2) • (3.1, 3.2, 3.3, 3.4) • (4.1, 4.2, 4.3) • (5.1) • (6.1, 6.2, 6.3, 6.4) K_vα7-12 (7.1, 7.2, 7.3, 7.4, 7.5) • (8.1, 8.2) • (9.1, 9.2, 9.3) • (10.1, 10.2) • (11.1/hERG, 11.2, 11.3) • (12.1, 12.2, 12.3) K_vβ (1, 2, 3) • KCNIP (1, 2, 3, 4) • minK/ISK • minK/ISK-sličan • MiRP (1, 2, 3) • Shaker gen
Kalcijumom-aktivirani	BK kanal (α1, β1, β2, β3, β4) • SK kanal (SK1, SK2, SK3, SK4) • K_Ca (1.1, 2.1, 2.2, 2.3, 3.1, 4.1, 4.2, 5.1)
Unutrašnje-ispravljajući	K_ATP • K_ir (1.1, 2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.6) • GIRK/K_ir (3.1, 3.2, 3.3, 3.4) • K_ir (4.1, 4.2, 5.1, 6.1, 6.2, 7.1)
Tandem pora domen	K2P (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 12, 13, 15, 16, 17, 18)

Drugi

M⁺: TRP katjonski kanal	TRPA (1) • TRPC (1, 2, 3, 4, 4AP, 5, 6, 7) • TRPM (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • TRPML (1, 2, 3) • TRPP (1, 2) • TRPV (1, 2, 3, 4, 5, 6)
Cl^-: Hloridni kanal	ANO1 • Bestrofin (1, 2) • CFTR • CLCA (1, 2, 3, 4) • CLCN (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, KA, KB) • CLIC (1, 2, 3, 4, 5, 6, L1) • CLNS (1A, 1B)
Cikličnim nukleotidom-kontrolisani (FC)	α (1, 2, 3, 4) • β (1, 2, 3) • HCN (1, 2, 3, 4)
Porin	Akvaporin (1, 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9) • Napon-zavisni anjonski kanal (1, 2, 3) • Generalna bakterijska porinska familija
Propusna veza	Koneksin: A (GJA1, GJA3, GJA4, GJA5, GJA8, GJA9, GJA10) • B (GJB1, GJB2, GJB3, GJB4, GJB5, GJB6, GJB7) • C (GJC1, GJC2, GJC3) • D (GJD2, GJD3, GJD4) • E (GJE1) Ineksin
Generalno	Ligandom-kontrolisani jonski kanal • Naponom-kontrolisani jonski kanal • Rastezanjem-aktivirani jonski kanal

vidi isto poremećaji
B memb: cead, trns (1A, 1C, 1F, 2A, 3A1, 3A2-3, 3D), othr

Ćelijska fiziologija: prenos signala / ćelijska signalizacija

Signalni putevi

G protein-spregnuti receptor (Hedgehog, Wnt) • RTK (TGF beta, MAPK/ERK) • Notch • JAK-STAT • Akt/PKB • Fas apoptoza • Hippo • PI3K/AKT/mTOR put • Integrinski receptori

Agensi

Receptorski ligandi	Hormoni • Neurotransmiteri/Neuropeptidi • Citokini • Faktori rasta
Receptori	Ćelijska površina • Intracelularni • Co-receptori
Intracelularna signalizacija	Signal provodeći adapterski protein: Gradivni protein Drugi glasnik: cAMP-zavisni put • Ca²⁺ signalizacija • Lipidna signalizacija • IP3/DAG put
Transkripcioni faktori	Generalni • Transkripcioni preinicijacioni kompleks • TFIID, TFIIH

Po lokaciji

Intrakrina • Autokrina • Jukstakrina • Parakrina • Endokrina

Drugi koncepti

Signalni molekul • Jonski kanal • Mehanotransdukcija • Fototransdukcija • Sinaptička transmisija

B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)