DnaX : Reference Wikipedia, slobodna enciklopedija

DnaX

Tau i gama podjednice DNK polimeraze III
Identifikatori
Organizam	Escherichia coli (vrsta K-12, podvrsta MG1655)
Simbol	dnaX
Alt. simboli	dnaZ; ECK0464; JW0459
Entrez	945105
RefSeq (Prot)	NP_415003.1
UniProt	P06710
Other data
EC broj	2.7.7.7
Hromozom	genome: 0.49 - 0.49 Mb

DNK polimeraza III, podjedinica tau, domen IV DnaB vezujući

Identifikatori

Simbol

DNA_pol3_tau_4

Pfam

PF12168

InterPro

IPR022001

Dostupne PDB strukture:
Pfam	structures
PDB	RCSB PDB; PDBe
PDBsum	strukturni pregled

DNK polimeraza III, tau podjedinica V, interaguje sa alfa

Identifikatori

Simbol

DNA_pol3_tau_5

Pfam

PF12170

InterPro

IPR021029

Dostupne PDB strukture:
Pfam	structures
PDB	RCSB PDB; PDBe
PDBsum	strukturni pregled

DnaX je gen koji kodira τ i γ podjedinice postavljača DNK stege kod prokariota.^[1] Eukariotski ekvivalent postavljača DNK stege je replikacioni faktor C, koji je kodira genima RFC1, RFC2, RFC3, RFC4, i RFC5.

Reference

↑ Z Tsuchihashi and A Kornberg (1989). „ATP interactions of the tau and gamma subunits of DNA polymerase III holoenzyme of Escherichia coli”. The Journal of Biological Chemistry 264: 17790-17795.

DNK replikacija (Prokariotska, Eukariotska)

Separacija
i inicijacija

Prokariotska (inicijacija)	Prereplikacioni kompleks Cdc6 Helikaza (dnaA, dnaB, T7) • Primaza (dnaG)
Eukariotska (priprema u G1 fazi)	Prereplikacioni kompleks: Kompleks prepoznavanja mesta početka (ORC1, ORC2, ORC3, ORC4, ORC5, ORC6) • Održavanje minihromozoma (MCM2 • MCM3 • MCM4 • MCM5 • MCM6 • MCM7) • CDC6 Faktor licenciranja Autonomna replikaciona sekvenca Protein jednolančanog vezivanja (SSBP1, SSBP2, SSBP3) RNaza H (RNASEH1, RNASEH2A) Helikaza: HFM1 Primaza: PRIM1 • PRIM2
Oba	Početak replikacije/Ori/Replikon Replikaciona viljuška (zaostajući i vodeći lanci) • Okazakijev fragment • Prajmer

Replikacija

Prokariotska (elongacija)	DNK polimeraza III holoenzim (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) • Replizom • DNK ligaza • DNK stega • Topoizomeraza (DNK giraza) Prokariotska DNK polimeraza: DNK polimeraza I (Klenov fragment)
Eukariotska (sinteza u S fazi)	Replikacioni faktor C (RFC1, RFC2, RFC3, RFC4, RFC5) • Endonukleaza prepusta (FEN1) • Topoizomeraza • Replikacioni protein A (RPA1) Eukariotska DNK polimeraza: delta (POLD1, POLD2, POLD3, POLD4) DNK stega (PCNA)
Oba	Kretanje: Procesivnost • DNK ligaza

Terminacija

Telomera: Telomeraza (TERT, TERC, DKC1)

B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) • tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) • tltn (risu, pttl, nexn) • dnab, rnab/runp • stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)