EGR3

早期生长应答蛋白3
Early growth response 3
标识
代号 EGR3; EGR-3; PILOT
扩展标识 遗传学:602419 鼠基因:1306780 同源基因:37923 GeneCards: EGR3 Gene
基因本体论描述
分子功能 · DNA binding

· sequence-specific DNA binding transcription factor activity

· zinc ion binding
细胞成分 · nucleus
生物过程 · positive regulation of endothelial cell proliferation

· cell migration involved in sprouting angiogenesis
· transcription, DNA-dependent
· neuromuscular synaptic transmission
· peripheral nervous system development
· muscle organ development
· circadian rhythm
· endothelial cell chemotaxis
· cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus
· negative regulation of apoptotic process

· cellular response to fibroblast growth factor stimulus
Sources: Amigo / QuickGO
RNA表达模式
更多表达数据
直系同源体
物种 人类 小鼠
Entrez 1960 13655
Ensembl ENSG00000179388 ENSMUSG00000033730
UniProt Q06889 P43300
mRNA序列 NM_001199880 NM_018781
蛋白序列 NP_001186809 NP_061251
基因位置 Chr 8:
22.55 – 22.55 Mb
Chr 14:
70.08 – 70.08 Mb
PubMed查询 [1] [2]

早期生长反应蛋白3(英語:Early growth response protein 3EGR-3)是一个由人类基因EGR3编码的蛋白质[1][2][3]

该基因编码的蛋白为EGR家族的Cys2His2型锌指结构转录因子。这是一个是由有丝分裂刺激诱导的早期生长反应基因。由该基因编码的蛋白参与了控制生物节律的转录调控。它也可能在肌肉发育中起作用。[3]

参考文献

  1. ^ Patwardhan S, Gashler A, Siegel MG, Chang LC, Joseph LJ, Shows TB, Le Beau MM, Sukhatme VP. EGR3, a novel member of the Egr family of genes encoding immediate-early transcription factors. Oncogene. Aug 1991, 6 (6): 917–28. PMID 1906159. 
  2. ^ Yang Y, Dong B, Mittelstadt PR, Xiao H, Ashwell JD. HIV Tat binds Egr proteins and enhances Egr-dependent transactivation of the Fas ligand promoter. J Biol Chem. May 2002, 277 (22): 19482–19487. PMID 11909874. doi:10.1074/jbc.M201687200. 
  3. ^ 3.0 3.1 Entrez Gene: EGR3 early growth response 3. (原始内容存档于2019-10-16). 

延伸阅读

  • Yamada K; Gerber DJ; Iwayama Y; et al. Genetic analysis of the calcineurin pathway identifies members of the EGR gene family, specifically EGR3, as potential susceptibility candidates in schizophrenia. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104 (8): 2815–2820. PMC 1815264可免费查阅. PMID 17360599. doi:10.1073/pnas.0610765104. 
  • Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 2004, 14 (10B): 2121–2127. PMC 528928可免费查阅. PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504. 
  • Yoo YG, Lee MO. Hepatitis B virus X protein induces expression of Fas ligand gene through enhancing transcriptional activity of early growth response factor. J. Biol. Chem. 2004, 279 (35): 36242–36249. PMID 15173177. doi:10.1074/jbc.M401290200. 
  • Inoue A; Omoto Y; Yamaguchi Y; et al. Transcription factor EGR3 is involved in the estrogen-signaling pathway in breast cancer cells. J. Mol. Endocrinol. 2005, 32 (3): 649–661. PMID 15171706. doi:10.1677/jme.0.0320649. 
  • Liu D; Jia H; Holmes DI; et al. Vascular endothelial growth factor-regulated gene expression in endothelial cells: KDR-mediated induction of Egr3 and the related nuclear receptors Nur77, Nurr1, and Nor1. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2004, 23 (11): 2002–2007. PMID 14525795. doi:10.1161/01.ATV.0000098644.03153.6F. 
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 99 (26): 16899–16903. PMC 139241可免费查阅. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899. 
  • Tourtellotte WG, Milbrandt J. Sensory ataxia and muscle spindle agenesis in mice lacking the transcription factor Egr3. Nat. Genet. 1998, 20 (1): 87–91. PMID 9731539. doi:10.1038/1757. 
  • Morris ME; Viswanathan N; Kuhlman S; et al. A screen for genes induced in the suprachiasmatic nucleus by light. Science. 1998, 279 (5356): 1544–1547. PMID 9488654. doi:10.1126/science.279.5356.1544. 
  • Hillier LD; Lennon G; Becker M; et al. Generation and analysis of 280,000 human expressed sequence tags. Genome Res. 1997, 6 (9): 807–828. PMID 8889549. doi:10.1101/gr.6.9.807. 
  • Mages HW; Stamminger T; Rilke O; et al. Expression of PILOT, a putative transcription factor, requires two signals and is cyclosporin A sensitive in T cells. Int. Immunol. 1993, 5 (1): 63–70. PMID 8443122. doi:10.1093/intimm/5.1.63. 

外部链接


EGR3引用了美国国家医学图书馆提供的資料,这些資料属于公共领域

 
(1) 碱性结构域
(1.1)碱性亮氨酸拉链
bZIP英语bZIP domain
转录激活因子英语Activating transcription factorAATF英语Apoptosis-antagonizing transcription factor、1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 ·
C/EBPαβγδ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) ·
NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1
(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
bHLH
ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) ·
HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 ·
肌形成调节因子英语Myogenic regulatory factors(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD(1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 ·
Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1
(1.3)bHLH-ZIP英语Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors
AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2)
(1.4) NF-1
NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4)
(1.5) RF-X
RFX(1、2、3、4、5、ANK)
(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋英语Basic helix-span-helix
(bHSH)
AP-2(α、β、γ、δ、ε)
 
(2) 锌指结构DNA作用区域
(2.1) 核受体Cys4
第一亚族:甲状腺激素受体αβ)、CAR、FXRLXR(α、β)、PPARα英语Peroxisome proliferator-activated receptor alpha、β/δ、γ)、PXR、RAR(α、β、γ)、ROR(α、β、γ)、
Rev-ErbA(α、β)、VDR
第二亚族(COUP-TF(I、II)、Ear-2英语V-erbA-related geneHNF4英语Hepatocyte nuclear factor 4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX)
第三亚族(甾类激素英语Steroid hormone receptor雄激素、雌激素(α、β)、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮)、雌激素相关英语Estrogen related receptor(α、β、γ))
第四亚族NUR英语Nur (biology)(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF英语Germ cell nuclear factor · 第零亚族DAX1、SHP英语Small heterodimer partner
(2.2) 其他的Cys4结构
GATA英语GATA transcription factor(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1英语Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1
(2.3) Cys2His2
通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2))
ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、2、3、4 · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) ·
HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族KLF:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17,SP:1、2、4、7、8 · MTF1 · MYT1 ·
OSR1 ·  · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、
34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、
423、451、452、471、593、638、649、655)
(2.4) Cys6
HIVEP1
(2.5)交替composition
AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B
(2.6)WRKY结构
WRKY转录因子家族英语WRKY transcription factor family
 
(3)螺旋-转角-螺旋结构域
ARX英语Aristaless related homeobox · CDX1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2)  · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、
D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子:1、2、3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB1、2)
(3.2)配对框
PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9)
(3.3)叉头状/翼状螺旋
E2F1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2P3
(3.4)热休克因子英语Heat Shock Factor
HSF(1、2、4)
(3.5)色氨酸簇英语Tryptophan clusters
ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2
(3.6)TEA结构域
transcriptional enhancer factor(1、2、3、4)
 
(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子
(4.1) Rel homology region英语Rel homology domain
NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5)
(4.2) STAT
STAT1234、5、6
(4.3) p53样转录因子
p53 p63 p73家族p53 · p63 · p73 · TBX(1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1)
(4.4) MADS盒
Mef2(A、B、C、D) · SRF
(4.7) 高迁移率族
BBX英语BBX (gene) · HMGB1英语HMGB12英语HMGB23英语HMGB34英语HMGB4 · HMGN英语HMGN、(1英语HMGN12英语HMGN23英语HMGN34英语HMGN4 · HNF(1A、1B) · SOX(1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY · SSRP1 ·
TCF/LEF家族TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4)
(4.9) Grainyhead英语Grainyhead
TFCP2
(4.10) 冷休克域英语Cold-shock domain
CSDA、YBX1
(4.11) Runt
CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1)
 
(0) 其他转录因子
(0.2) HMGI(Y)
HMGA(1、2) · HBP1
(0.3) 袋状结构域
Rb · RBL1英语Retinoblastoma-like protein 1 · RBL2英语Retinoblastoma-like protein 2
(0.5) AP-2/EREBP-related factors
Apetala 2 · EREBP英语Ethylene-responsive element binding protein · B3(ARF · ABI3 · RAV)
(0.6) Miscellaneous
ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/σ因子
参见 转录因子/共调节因子缺陷英语Template:Transcription factor/coregulator deficiencies
Category:蛋白质生物合成模板