ZSCAN21

Ідентифікатори

Символи

ZSCAN21, NY-REN-21, ZNF38, Zipro1, zinc finger and SCAN domain containing 21

Зовнішні ІД

OMIM: 601261 MGI: 99182 HomoloGene: 56530 GeneCards: ZSCAN21

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7589


22697

Ensembl


ENSG00000166529


ENSMUSG00000037017

UniProt


Q9Y5A6


Q07231

RefSeq (мРНК)


NM_145914 NM_001362779 NM_001362780 NM_001362781


NM_001044703 NM_001044704 NM_001044705 NM_011757

RefSeq (білок)


NP_666019 NP_001349708 NP_001349709 NP_001349710


NP_001038168 NP_001038169 NP_001038170 NP_035887

Локус (UCSC)

Хр. 7: 100.05 – 100.07 Mb

Хр. 5: 138.12 – 138.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZSCAN21 (англ. Zinc finger and SCAN domain containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 53 658^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMTKVLGMAP	VLGPRPPQEQ	VGPLMVKVEE	KEEKGKYLPS	LEMFRQRFRQ
FGYHDTPGPR	EALSQLRVLC	CEWLRPEIHT	KEQILELLVL	EQFLTILPQE
LQAWVQEHCP	ESAEEAVTLL	EDLERELDEP	GHQVSTPPNE	QKPVWEKISS
SGTAKESPSS	MQPQPLETSH	KYESWGPLYI	QESGEEQEFA	QDPRKVRDCR
LSTQHEESAD	EQKGSEAEGL	KGDIISVIIA	NKPEASLERQ	CVNLENEKGT
KPPLQEAGSK	KGRESVPTKP	TPGERRYICA	ECGKAFSNSS	NLTKHRRTHT
GEKPYVCTKC	GKAFSHSSNL	TLHYRTHLVD	RPYDCKCGKA	FGQSSDLLKH
QRMHTEEAPY	QCKDCGKAFS	GKGSLIRHYR	IHTGEKPYQC	NECGKSFSQH
AGLSSHQRLH	TGEKPYKCKE	CGKAFNHSSN	FNKHHRIHTG	EKPYWCHHCG
KTFCSKSNLS	KHQRVHTGEG	EAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13104 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5A6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.