VCAM1

VCAM1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1IJ9, 1VCA, 1VSC

Ідентифікатори
Символи VCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД OMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• primary amine oxidase activity
• integrin binding
• cell adhesion molecule binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• комплекс Ґольджі
• alpha9-beta1 integrin-vascular cell adhesion molecule-1 complex
• мембрана
• Філоподія
• клітинна мембрана
• apical part of cell
• Мікроворсинки
• cell surface
• early endosome
• ендоплазматичний ретикулум
• podosome
• Сарколема
• екзосома
• external side of plasma membrane
• міжклітинний простір
• integral component of plasma membrane

Біологічний процес

• leukocyte cell-cell adhesion
• response to ionizing radiation
• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• response to hypoxia
• response to nutrient
• interferon-gamma-mediated signaling pathway
• cellular response to tumor necrosis factor
• response to nicotine
• GO:0010260 старіння людини
• response to zinc ion
• extracellular matrix organization
• amine metabolic process
• response to lipopolysaccharide
• адгезія клітин
• acute inflammatory response
• positive regulation of T cell proliferation
• membrane to membrane docking
• regulation of immune response
• leukocyte tethering or rolling
• cell chemotaxis
• B cell differentiation
• cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus
• cell-matrix adhesion
• GO:0022415 viral process
• response to ethanol
• calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
• chronic inflammatory response
• cell-cell adhesion
• cytokine-mediated signaling pathway
• heterotypic cell-cell adhesion
• іннервація
• cardiac neuron differentiation
• cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus
• cellular response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7412
22329
Ensembl
ENSG00000162692
ENSMUSG00000027962
UniProt
P19320
P29533
RefSeq (мРНК)
NM_080682
NM_001078
NM_001199834
NM_011693
RefSeq (білок)
NP_001069
NP_001186763
NP_542413
NP_035823
Локус (UCSC) Хр. 1: 100.72 – 100.74 Mb Хр. 3: 115.9 – 115.92 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

VCAM1 (англ. Vascular cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 81 276[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTT
GCESPFFSWRTQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCE
SRKLEKGIQVEIYSFPKDPEIHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEI
DLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEVTFTPVIEDIGKVLVCRAKLH
IDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGGSVTMTCSSEG
LPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQ
IDSPLSGKVRSEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVEL
YSFPRDPEIEMSGGLVNGSSVTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENI
EFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKALVCQAKLHIDDMEFEPKQRQ
STQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFPAPKILWSRQL
PNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSID
GAYTIRKAQLKDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELL
VLYFASSLIIPAIGMIIYFARKANMKGSYSLVEAQKSKV

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

  • Polte T., Newman W., Gopal T.V. (1990). Full length vascular cell adhesion molecule 1 (VCAM-1). Nucleic Acids Res. 18: 5901—5901. PMID 1699207 DOI:10.1093/nar/18.19.5901
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Osborn L., Vassallo C., Benjamin C.D. (1992). Activated endothelium binds lymphocytes through a novel binding site in the alternately spliced domain of vascular cell adhesion molecule-1. J. Exp. Med. 176: 99—107. PMID 1377228 DOI:10.1084/jem.176.1.99
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
  • Iademarco M.F., McQuillan J.J., Rosen G.D., Dean D.C. (1992). Characterization of the promoter for vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1). J. Biol. Chem. 267: 16323—16329. PMID 1379595

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, P19320 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350