RBPMS

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5DET, 5CYJ

Ідентифікатори

Символи

RBPMS, HERMES, RNA binding protein with multiple splicing, RNA binding protein, mRNA processing factor

Зовнішні ІД

OMIM: 601558 MGI: 1334446 HomoloGene: 38238 GeneCards: RBPMS

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(A) binding • nucleic acid binding • protein homodimerization activity • RNA binding • U1 snRNA binding • snRNA stem-loop binding • mRNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • P-body • cytoplasmic stress granule • U1 snRNP • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of SMAD protein signal transduction • GO:0001306 response to oxidative stress • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11030


19663

Ensembl


ENSG00000157110


ENSMUSG00000031586

UniProt


Q93062


Q9WVB0

RefSeq (мРНК)


NM_001008710 NM_001008711 NM_001008712 NM_006867


NM_001042674 NM_001042675 NM_001286168 NM_019733

RefSeq (білок)


NP_001008710 NP_001008711 NP_001008712 NP_006858


NP_001036139 NP_001036140 NP_001273097 NP_062707

Локус (UCSC)

Хр. 8: 30.38 – 30.57 Mb

Хр. 8: 34.27 – 34.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBPMS (англ. RNA binding protein with multiple splicing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 196 амінокислот, а молекулярна маса — 21 802^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNNGGKAEKE	NTPSEANLQE	EEVRTLFVSG	LPLDIKPREL	YLLFRPFKGY
EGSLIKLTSK	QPVGFVSFDS	RSEAEAAKNA	LNGIRFDPEI	PQTLRLEFAK
ANTKMAKNKL	VGTPNPSTPL	PNTVPQFIAR	EPYELTVPAL	YPSSPEVWAP
YPLYPAELAP	ALPPPAFTYP	ASLHAQMRWL	PPSEATSQGW	KSRQFC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Teplova M., Farazi T.A., Tuschl T., Patel D.J. (2015). Structural basis underlying CAC RNA recognition by the RRM domain of dimeric RNA-binding protein RBPMS. Q. Rev. Biophys. 2015: 1—11. PMID 26347403 DOI:10.1017/S0033583515000207

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19097 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q93062 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.