Intracelularni receptor

Intracelularni receptori su receptori locirani unutar ćelije umesto na površini ćelijske membrane.^[1]^[2] Primeri takvih receptora su klasa nuklearnih receptora^[3]^[4] lociranih u jedru i citoplazmi i IP₃ receptor lociran na endoplazmatičnom retikulumu. Ligandi koji se vezuju za njih su obično intracelularni sekundarni glasnici poput inozitol trisfosfata (IP₃) i ekstracelularni lipofilni hormoni, npr. steroidni hormoni. Pojedini intrakrini peptidni hormoni su takođe intracelularni receptori.

Primeri

transkripcioni faktori
- nuklearni receptori

drugi
- Sigma1 (neurosteroidi)
- IP₃ receptor (inozitol trifosfat, IP₃)

Vidi još

Receptor
Steroidni hormon

Reference

^ Donald Voet; Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 изд.). Wiley. ISBN 9780471193500.
^ Friedrich Marks; Ursula Klingmüller; Karin Müller-Decker (2008). Cellular Signal Processing: An Introduction to the Molecular Mechanisms of Signal Transduction (1st изд.). New York: Garland Science. ISBN 0815342152.
^ Olefsky JM (2001). „Nuclear receptor minireview series”. J. Biol. Chem. 276 (40): 36863—4. PMID 11459855. doi:10.1074/jbc.R100047200.
^ Evans RM (1988). „The steroid and thyroid hormone receptor superfamily”. Science. 240 (4854): 889—95. PMID 3283939. doi:10.1126/science.3283939.

Literatura

Spoljašnje veze

Nuclear Receptor journal homepage
Nuclear receptor resource at Georgetown University
Nuclear receptor signalling atlas (NURSA, open-access journal)

Ćelijska komunikacija

Ključni koncepti

Transdukcija signala
Apoptoza
Sistemi sekundarnih glasnika (Ca²⁺ signalizacija
Lipidna signalizacija
Kvorum očitavanje)

Procesi

Parakrini
Autokrini
Jukstakrini
Neurotransmiteri
Endokrini (Neuroendokrini)
Intrakrini

Signalni putevi

Hedgehog signalni put
Wnt signalni put
TGF beta signalni put
MAPK/ERK put
Notch signalni put
JAK-STAT signalni put
cAMP zavisni put
Akt/PKB signalni put
Fas apoptozni signalni put
Hippo signalni put
IP3/DAG put

Agensi

Ligandi	Hormoni Neurotransmiteri Citokini Faktori rasta
Receptor	Transmembranski Intracelularni
Transkripcioni faktori	Generalni Preinicijacioni kompleks TFIID TFIIH
Drugi	Adapter protein Protein osnove

Ćelijska fiziologija: prenos signala / ćelijska signalizacija

Signalni putevi

G protein-spregnuti receptor (Hedgehog, Wnt) · RTK (TGF beta, MAPK/ERK) · Notch · JAK-STAT · Akt/PKB · Fas apoptoza · Hippo · PI3K/AKT/mTOR put · Integrinski receptori

Agensi

Receptorski ligandi	Hormoni · Neurotransmiteri/Neuropeptidi · Citokini · Faktori rasta
Receptori	Ćelijska površina · Intracelularni · Co-receptori
Intracelularna signalizacija	Signal provodeći adapterski protein: Gradivni protein Drugi glasnik: cAMP-zavisni put · Ca²⁺ signalizacija · Lipidna signalizacija · IP3/DAG put
Transkripcioni faktori	Generalni · Transkripcioni preinicijacioni kompleks · TFIID, TFIIH

Po lokaciji

Intrakrina · Autokrina · Jukstakrina · Parakrina · Endokrina

Drugi koncepti

Signalni molekul · Jonski kanal · Mehanotransdukcija · Fototransdukcija · Sinaptička transmisija

B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)

Transkripcioni faktori i intracelularni receptori

(1) Osnovni domeni

(1.1) Osnovni leucinski zatvarač (bZIP)	Aktivirajući transkripcioni faktor (AATF, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7) • AP-1 (c-Fos, FOSB, FOSL1, FOSL2, c-Jun, JUNB, JUND) • BACH (1, 2) • BATF • BLZF1 • C/EBP (α, β, γ, δ, ε, ζ) • CREB (1, 3, L1) • CREM • DBP • DDIT3 • GABPA • HLF • MAF (B, F, G, K) • NFE (2, L1, L2) • NFIL3 • NRL • NRF1 • XBP1
(1.2) Osnovni heliks-petlja-heliks (bHLH)	ATOH1 • AhR • AHRR • ARNT • ASCL1 • BHLHB2 • BMAL (ARNTL, ARNTL2) • CLOCK • EPAS1 • HAND (1, 2) • HES (5, 6) • HEY (1, 2, L) • HES1 • HIF (1A, 3A) • ID (1, 2, 3, 4) • LYL1 • MXD4 • MYCL1 • MYCN • Myogenic regulatorni faktori (MyoD, Myogenin, MYF5, MYF6) • Neurogenini (1, 2, 3) • NeuroD (1, 2) • NPAS (1, 2, 3) • OLIG (1, 2) • Pho4 • Scleraxis • TAL (1, 2) • Twist • USF1
(1.3) bHLH-ZIP	AP-4 • MAX • MITF • MNT • MLX • MXI1 • Myc • SREBP (1, 2)
(1.4) NF-1	NFI (A, B, C, X) • SMAD (R-SMAD (1, 2, 3, 5, 9) - I-SMAD (6, 7) - 4)
(1.5) RF-X	RFX (1, 2, 3, 4, 5, ANK)
(1.6) Osnovni heliks-razmak-heliks (bHSH)	AP-2 (α, β, γ, δ, ε)

(2) DNA-vezujući domeni cinkovog prsta

(2.1) Nuklearni receptor (Cys₄)	potfamilija 1 (Tiroidni hormon (α, β), CAR, FXR, LXR (α, β), PPAR (α, β/δ, γ), PXR, RAR (α, β, γ), ROR (α, β, γ), Rev-ErbA (α, β), VDR) potfamilija 2 (COUP-TF (I, II), Ear-2, HNF4 (α, γ), PNR, RXR (α, β, γ), Testikularni receptor (2, 4), TLX) potfamilija 3 (Steroidni hormon (Androgen, Estrogen (α, β), Glukokortikoid, Mineralokortikoid, Progesteron), Estrogen-vezani (α, β, γ)) potfamilija 4 NUR (NGFIB, NOR1, NURR1) • potfamilija 5 (LRH-1, SF1) • potfamilija 6 (GCNF) • potfamilija 0 (DAX1, SHP)
(2.2) Drugi Cys₄	GATA (1, 2, 3, 4, 5, 6) • MTA (1, 2, 3) • TRPS1
(2.3) Cys₂His₂	Generalni transkripcioni faktori (TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF (1, 2), TFIIH (1, 2, 4, 2I, 3A, 3C1, 3C2)) ATBF1 • BCL (6, 11A, 11B) • CTCF • E4F1 • EGR (2, 3) • ERV3 • GFI1 • GLI-Kruppel familija (1, 2, 3, REST, S2, YY1) • HIC (1, 2) • HIVEP (1, 2, 3) • IKZF (1, 2, 3) • ILF (2, 3) • KLF (2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 17) • MTF1 • MYT1 • OSR1 • SP (1, 2, 4, 7) • WT1 • Zbtb7 (7A, 7B) • ZBTB (16, 17, 20, 32, 33, 40) • cink prst (3, 7, 9, 10, 19, 22, 24, 33B, 34, 35, 41, 43, 44, 51, 74, 143, 146, 148, 165, 202, 217, 219, 238, 239, 259, 267, 268, 281, 295, 318, 330, 346, 350, 365, 366, 384, 423, 451, 452, 471, 593, 638, 649, 655)
(2.4) Cys₆	HIVEP1
(2.5) Naizmenična kompozicija	AIRE • DIDO1 • GRLF1 • ING (1, 2, 4) • JARID (1A, 1B, 1C, 1D, 2) • JMJD1B

(3) Heliks-zavoj-heliks domeni

(3.1) Homeodomen	ARX • CDX (1, 2) • CRX • CUTL1 • DBX (1, 2) • DLX (3, 4, 5) • EMX2 • EN (1, 2) • FHL (1, 2, 3) • HESX1 • HHEX • HLX • Homeobox (A1, A2, A3, A4, A5, A7, A9, A10, A11, A13, B1, B2, B3, B4, B5, B6, B7, B8, B9, B13, C4, C5, C6, C8, C9, C10, C11, C13, D1, D3, D4, D8, D9, D10, D11, D12, D13) • HOPX • IRX (1, 2, 3, 4, 5, 6, MKX) • LMX (1A, 1B) • MEIS (1, 2) • MEOX2 • MNX1 • MSX (1, 2) • NANOG • NKX (2-1, 2-2, 2-3, 2-5, 3-1, 3-2, 6-1, 6-2) • PBX (1, 2, 3) • PHF (1, 3, 6, 8, 10, 16, 17, 20, 21A) • PITX (1, 2, 3) • POU domen (PIT-1, BRN-3: A, B, C, Oktamer transkripcioni faktor: 1, 2, 3/4, 6, 7, 11) • OTX (1, 2) • PDX1 • ZEB (1, 2)
(3.2) Paired box	PAX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9)
(3.3) Fork glava / winged heliks	E2F (1, 2, 3, 4, 5) • FOX proteini (C1, C2, D3, E1, G1, H1, K2, L2, M1, N3, O1, O3, O4, P1, P2, P3)
(3.4) Faktori toplotnog šoka	HSF (1, 2, 4)
(3.5) Triptofan klasteri	ELF (2, 4, 5) • EGF • ELK (1, 3, 4) • ERF • ERG • ETS (1, 2, SPIB) • ETV (1, 4, 5, 6) • FLI1 • Interferon regulatorni faktori (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • MYB • MYBL2
(3.6) TEA domen	transkripcioni pojačivač faktor (1, 2, 3, 4)

(4) β-Scaffold faktori sa manjim žljebnim kontaktima

(4.1) Rel homologni region	NF-κB (NFKB1, NFKB2, REL, RELA, RELB) • NFAT (C1, C2, C3, C4, 5)
(4.2) STAT	STAT (1, 2, 3, 4, 5, 6)
(4.3) p53	p53 • TBX (1, 2, 3, 5, 19, 21, 22, Brahiuri, TBR1)
(4.4) MADS kutija	Mef2 (A, B, C, D) • SRF
(4.6) TATA vezujući proteini	TBP • TBPL1
(4.7) Grupa visoke pokretljivosti	HMGB (1, 2, 3) • HNF (1A, 1B) • LEF1 • SOX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 21) • SRY • SSRP1 • TCF (3, 4) • TOX (1, 2, 3, 4)
(4.10) Domen hladnog šoka	CSDA, YBX1
(4.11) Runt	CBF (CBFA2T2, CBFA2T3, RUNX1, RUNX2, RUNX3, RUNX1T1)

(0) Drugi transkripcioni faktori

(0.2) HMGI(Y)	HMGA (1, 2) • HBP1
(0.3) Džep domen	Rb • RBL1 • RBL2
(0.5) AP-2/EREBP-vezani faktori	Apetala 2 • EREBP • B3
(0.6) Razno	ARID (1A, 1B, 2, 3A, 3B, 4A) • CAP • IFI (16, 35) • MLL (2, 3, T1) • MNDA • NFY (A, B, C) • Ro/Sigma

vidi isto transkripcioni faktor/koregulator nedostataka
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) · tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) · tltn (risu, pttl, nexn) · dnab, rnab/runp · stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)