SLAMF8

SLAMF8
Идентификаторы
ПсевдонимыSLAMF8, BLAME, CD353, SBBI42, SLAM family member 8
Внешние IDOMIM: 606620 MGI: 1921998 HomoloGene: 10589 GeneCards: SLAMF8
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме SLAMF8
Расположение в геноме SLAMF8
Локус1q23.2Начало159,826,811 bp[1]
Конец159,837,492 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме SLAMF8
Расположение в геноме SLAMF8
Локус1|1 H3Начало172,409,325 bp[2]
Конец172,418,135 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • lower lobe of lung

  • decidua
Наибольшая экспрессия в
  • lumbar subsegment of spinal cord

  • subcutaneous adipose tissue
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • signaling receptor activity
  • связывание похожих белков
Компонент клетки
  • мембрана
  • часть мембраны
  • поверхность клетки
Биологический процесс
  • leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response
  • B-1 B cell lineage commitment
  • negative regulation of macrophage chemotaxis
  • regulation of NAD(P)H oxidase activity
  • defense response to bacterium
  • regulation of kinase activity
  • regulation of B cell differentiation
  • negative regulation of respiratory burst involved in inflammatory response
  • negative regulation of monocyte chemotaxis
  • phagosome acidification
  • negative regulation of neutrophil migration
  • negative regulation of dendritic cell chemotaxis
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

56833

74748

Ensembl

ENSG00000158714

ENSMUSG00000053318

UniProt

Q9P0V8

Q9D3G2

RefSeq (мРНК)

NM_020125
NM_001330741

NM_029084

RefSeq (белок)

NP_001317670
NP_064510

NP_083360

Локус (UCSC)Chr 1: 159.83 – 159.84 MbChr 1: 172.41 – 172.42 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

SLAMF8мембранный белок, продукт гена человека SLAMF8[5][6]. Входит в семейство сигнальных лимфоцитарных молекул активации (англ. Signaling lymphocytic activation molecule, SLAM).

Функции

Белок относится к трансмембранным белкам 1-го типа подсемейства CD2 суперсемейства иммуноглобулинов. Играет роль в активации лимфоцитов. Эспрессирован в лимфоидных тканях: лимфатических узлах, селезёнке, вилочковой железе и костном мозге. Может участвовать в дифференцировке миелоидных клеток-предшественников в B-лимфоциты и/или модуляции сигнала, опосредованного через рецептор B-лимфоцитов.

Структура

Белок состоит из 263 аминокислот, молекулярная масса 31,67 кДа. Внеклеточный участок содержит Ig-домен типа C2, 1 участок гликозилорования и 1 дисульфидную связь.

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000158714 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053318 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Kingsbury G.A., Feeney L.A., Nong Y., Calandra S.A., Murphy C.J., Corcoran J.M., Wang Y., Prabhu Das M.R., Busfield S.J., Fraser C.C., Villeval J.L. Cloning, expression, and function of BLAME, a novel member of the CD2 family (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2001. — May (vol. 166, no. 9). — P. 5675—5680. — doi:10.4049/jimmunol.166.9.5675. — PMID 11313408.
  6. Entrez Gene: SLAMF8 SLAM family member 8  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

Литература

  • Tangye S.G., Nichols K.E., Hare N.J., van de Weerdt B.C. Functional requirements for interactions between CD84 and Src homology 2 domain-containing proteins and their contribution to human T cell activation (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2003. — September (vol. 171, no. 5). — P. 2485—2495. — doi:10.4049/jimmunol.171.5.2485. — PMID 12928397.
  • Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites (англ.) // Protein Science[англ.] : journal. — 2004. — October (vol. 13, no. 10). — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400