Suksinil-KoA

Suksinil-KoA
Nama
Nama IUPAC
Asid 4-[(2-{3-[(2R)-4-{[1,3-dihidroksi-1,3-diokso-3-(3′-O-fosfonoadenosin-5′-O-il)-1λ5,3λ5-difosfoksan-1-yl]oksi}-3,3-dimetilbutanamido]propanamido}etil)sulfanil]-4-oksobutanoik
Nama IUPAC sistematik
Asid (9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-il)-4-hidroksi-3-(fosfonooksi)oksolan-2-il]-3,5,9-trihidroksi-8,8-dimetil-3,5,10,14,19-pentaokso-2,4,6-trioksa-18-tia-11,15-diaza-3λ5,5λ5-difosfadokosan-22-oik
Pengecam
No. Pendaftaran CAS
  • 604-98-8 ☑Y
Imej model 3D Jmol
  • Imej berinteraktif
ChEBI
  • CHEBI:15380 ☑Y
ChemSpider
  • 83179 ☑Y
ECHA InfoCard 100.009.163
MeSH succinyl-coenzyme+A
PubChem CID
  • 92133
UNII
  • BSI27HW5EQ ☑Y
CompTox Dashboard (EPA)
  • DTXSID40975809 Sunting ini di Wikidata
InChI
  • InChI=1S/C25H40N7O19P3S/c1-25(2,20(38)23(39)28-6-5-14(33)27-7-8-55-16(36)4-3-15(34)35)10-48-54(45,46)51-53(43,44)47-9-13-19(50-52(40,41)42)18(37)24(49-13)32-12-31-17-21(26)29-11-30-22(17)32/h11-13,18-20,24,37-38H,3-10H2,1-2H3,(H,27,33)(H,28,39)(H,34,35)(H,43,44)(H,45,46)(H2,26,29,30)(H2,40,41,42)/t13-,18-,19-,20+,24-/m1/s1 ☑Y
    Key: VNOYUJKHFWYWIR-ITIYDSSPSA-N ☑Y
  • InChI=1/C25H40N7O19P3S/c1-25(2,20(38)23(39)28-6-5-14(33)27-7-8-55-16(36)4-3-15(34)35)10-48-54(45,46)51-53(43,44)47-9-13-19(50-52(40,41)42)18(37)24(49-13)32-12-31-17-21(26)29-11-30-22(17)32/h11-13,18-20,24,37-38H,3-10H2,1-2H3,(H,27,33)(H,28,39)(H,34,35)(H,43,44)(H,45,46)(H2,26,29,30)(H2,40,41,42)/t13-,18-,19-,20+,24-/m1/s1
    Key: VNOYUJKHFWYWIR-ITIYDSSPBJ
SMILES
  • O=C(O)CCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]3O[C@@H](n2cnc1c(ncnc12)N)[C@H](O)[C@@H]3OP(=O)(O)O
Sifat
Formula kimia
C25H40N7O19P3S
Jisim molar 867.608
Kecuali jika dinyatakan sebaliknya, data diberikan untuk bahan-bahan dalam keadaan piawainya (pada 25 °C [77 °F], 100 kPa).
 ☑Y pengesahan (apa yang perlu: ☑Y/N?)
Rujukan kotak info

Suksinil koenzim A atau singkatannya suksinil-KoA ialah tioester bagi asid suksinik dengan koenzim A.

Sumber

Ia merupakan molekul perantara penting dalam kitaran asid sitrik, di mana ia disintesis daripada α-ketoglutarat oleh α-ketoglutarat dehidrogenase melalui penyahkarboksilan. Semasa proses, koenzim A ditambah.

Dengan vitamin B12 sebagai kofaktor enzim, ia juga disintesis daripada propionol-KoA, asid lemak bernombor ganjil yang tidak boleh menjalani pengoksidaan beta.[1]

Propionol-KoA dikarboksil menjadi D-metilmalonil-KoA, diisomerkan menjadi L-metilmalonil-KoA, dan disusun semula untuk menghasilkan suksinil-KoA melalui enzim bergantungan vitamin B12. Walaupun suksinil-KoA ialah perantara kitaran asid sitrik, ia tidak boleh digabungkan dengan mudah di sana kerana tiada penggunaan bersih suksinil-KoA. Suksinil-KoA mula-mula ditukar kepada malat, dan kemudiannya kepada piruvat, di mana ia kemudiannya diangkut ke matriks untuk memasuki kitaran asid sitrik.

Kesudahan

Ia ditukar menjadi suksinat melalui pembebasan hidrolisis koenzim A oleh suksinil-KoA sintetase (suksinat tiokinase).

Satu lagi nasib suksinil-KoA ialah sintesis porfirin, di mana suksinil-KoA dan glisina digabungkan oleh ALA sintase untuk membentuk asid δ-aminolevulinik (dALA). Proses ini merupakan langkah komited dalam biosintesis porfobilinogen, dan seterusnya, hemoglobin.

Pembentukan

Suksinil-KoA boleh dibentuk daripada metilmalonil-KoA melalui penggunaan deoksiadenosil-B12 (deoksiadenosilkobalamin) oleh enzim metilmalonil-KoA mutase. Tindak balas ini yang memerlukan vitamin B12 sebagai kofaktor adalah penting dalam katabolisme beberapa asid amino rantai bercabang serta asid lemak rantaian ganjil.

Rujukan

  1. ^ Halarnkar PP, Blomquist GJ (1989). "Comparative aspects of propionate metabolism". Comp. Biochem. Physiol. B. 92 (2): 227–31. doi:10.1016/0305-0491(89)90270-8. PMID 2647392.
  • l
  • b
  • s
+ H
2
O
Templat:Biochem reaction arrow alt text
NADH +H+
NAD+
Templat:Biochem reaction arrow alt text
 
H2O
Templat:Biochem reaction arrow alt text
FADH2
FAD
Templat:Biochem reaction arrow alt text
KoA + ATP (GTP)
Pi + ADP (GDP)

Suksinil-KoA

NADH + H+ + CO2
KoA NAD+
 
H
2
O
Templat:Biochem reaction arrow alt text

cis-Akonitat

H
2
O
 
Templat:Biochem reaction arrow alt text
NAD(P)+
NAD(P)H + H+
Templat:Biochem reaction arrow alt text
 
CO2
Templat:Biochem reaction arrow alt text
  • l
  • b
  • s
K→asetil-KoA
lisina
  • Sakaropina
  • Alisina
  • Asid α-aminoadipik
  • Asid 2-oksoadipik
  • Glutaril-KoA
  • Glutakonil-KoA
  • Krotonil-KoA
  • β-Hidroksibutiril-KoA
leusina
  • Asid β-hidroksi β-metilbutirik
  • β-Hidroksi β-metilbutiril-KoA
  • Isovaleril-KoA
  • Asid α-ketoisokaproik
  • Asid β-ketoisokaproik
  • β-Ketoisokaproil-KoA
  • β-Leusina
  • β-Metilkrotonil-KoA
  • β-Metilglutakonil-KoA
  • β-Hidroksi β-metilglutaril-KoA
triptofanalanina
  • N′-Formilkinurenina
  • Kinurenina
  • Asid antranilik
  • 3-Hidroksikinurenina
  • Asid 3-hidroksiantranilik
  • 2-Amino-3-karboksimukonik semialdehid
  • 2-Aminomukonik semialdehid
  • Asid 2-aminomukonik
  • Glutaril-KoA
G
G→piruvat
sitrat
glisina
serina
G→glutamat
α-ketoglutarat
histidina
  • Asid urokanik
  • Asid imidazol-4-ona-5-propionik
  • Asid formiminoglutamik
  • Glutamat-1-semialdehid
prolina
  • asid 1-pirolina-5-karboksilik
arginina
lain-lain
G→propionil-KoA→
suksinil-KoA
valina
  • Asid α-ketoisovalerik
  • Isobutiril-KoA
  • Metakrilil-KoA
  • 3-Hidroksiisobutiril-KoA
  • Asid 3-hidroksiisobutirik
  • Asid 2-metil-3-oksopropanoik
isoleusina
  • Asid 2,3-dihidroksi-3-metilpentanoik
  • 2-Metilbutiril-KoA
  • Tiglil-KoA
  • 2-Metilasetoasetil-KoA
metionina
treonina
  • Asid α-ketobutirik
propionil-KoA→
  • Metilmalonil-KoA
G→fumarat
fenilalaninatirosina
  • Asid 4-hidroksifenilpiruvik
  • Asid homogentisik
  • Asid 4-maleilasetoasetik
G→oksaloasetat
Lain-lain
Metabolisme sisteina
  • Asid sulfinik sisteina