Cette saison, les matchs nuls disparaissent et font place à une séance de tirs de fusillade si aucun but n'est marqué lors de la prolongation.
De nombreux numéros sont retirés. En novembre, le numéro 12 de Dickie Moore et d'Yvan Cournoyer est retiré par les Canadiens de Montréal, les Oilers d'Edmonton retirent le numéro 7 de Paul Coffey et les Sabres de Buffalo retirent le numéro 18 de Danny Gare. En janvier, les Rangers de New York retirent le numéro 11 de Mark Messier et les Hurricanes de la Caroline retirent le numéro 10 de Ron Francis. Le , les Devils du New Jersey retirent le numéro 4 de Scott Stevens. En mars, les Sabres de Buffalo retirent le numéro 16 de Pat Lafontaine, les Canadiens de Montréal retirent le numéro 5 de Bernard Geoffrion et les Devils du New Jersey retirent le numéro 3 de Ken Daneyko. Enfin, le , les Blues de Saint-Louis retirent le numéro 2 de Al MacInnis.
Les franchises championnes de division sont classées aux trois premières places de chaque association ; les équipes classées aux huit premières places de chaque division sont qualifiées pour les séries éliminatoires et sont indiquées dans des lignes de couleur.
La finale de la Coupe Stanley 2006 oppose les Hurricanes de la Caroline, deuxièmes de l'association de l'Est, aux Oilers d'Edmonton, huitièmes et derniers qualifiés de l'association de l'Ouest. Les Hurricanes remportent la finale et la Coupe Stanley sur le score de 4 matchs à 3. Le gardien de but Cam Ward des Hurricanes est élu meilleur joueur des séries et remporte le trophée Conn-Smythe.